More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5030 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_27030  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  52.51 
 
 
853 aa  668    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.553859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3247  Osmosensitive K channel His kinase sensor  53.62 
 
 
853 aa  682    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1955  Osmosensitive K channel His kinase sensor  53.46 
 
 
902 aa  669    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1632  Osmosensitive K channel His kinase sensor  59.9 
 
 
844 aa  743    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  63.17 
 
 
851 aa  867    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3228  Osmosensitive K channel His kinase sensor  54.59 
 
 
854 aa  666    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1513  Osmosensitive K channel His kinase sensor  54.18 
 
 
832 aa  660    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.919123  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3283  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  65.82 
 
 
854 aa  796    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331513  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11046  two component system sensor histidine kinase kdpD  52.41 
 
 
860 aa  682    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1437  Osmosensitive K channel His kinase sensor  63 
 
 
854 aa  900    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.429266  normal  0.268919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4229  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  53.35 
 
 
836 aa  662    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6794  Osmosensitive K channel His kinase sensor  58.56 
 
 
891 aa  785    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431431  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1019  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  55.19 
 
 
858 aa  682    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0833425  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3803  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  62.58 
 
 
846 aa  838    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109811  normal  0.511029 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4295  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  53.35 
 
 
836 aa  662    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537586  normal  0.556945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4762  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  53.52 
 
 
850 aa  688    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400421  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3779  Osmosensitive K channel His kinase sensor  51.84 
 
 
857 aa  662    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135978  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5030  Osmosensitive K channel His kinase sensor  100 
 
 
815 aa  1596    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4607  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  53.22 
 
 
836 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0599  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  60.53 
 
 
938 aa  849    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1878  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  49.67 
 
 
883 aa  628  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.759992  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4089  Osmosensitive K channel His kinase sensor  49.41 
 
 
845 aa  620  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1707  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  49.15 
 
 
849 aa  600  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0300  Osmosensitive K channel His kinase sensor  51.98 
 
 
850 aa  602  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569489 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  38.33 
 
 
885 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
888 aa  438  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  37.97 
 
 
905 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 
912 aa  432  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
890 aa  426  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
889 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
905 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  36.23 
 
 
910 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.48 
 
 
907 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
892 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 
905 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
907 aa  415  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0236  osmosensitive K channel His kinase sensor  39.92 
 
 
905 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
901 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4239  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 
894 aa  405  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0665  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  37.26 
 
 
907 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 
902 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1024  two-component system, sensor kinase protein KdpD  36.74 
 
 
1035 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1396  two-component system, sensor kinase protein KdpD  36.7 
 
 
993 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1158  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
897 aa  398  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3249  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
944 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894868  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1245  sensor histidine kinase KdpD  36.7 
 
 
993 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.561584  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1253  sensor histidine kinase KdpD  36.7 
 
 
993 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139979  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4547  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 
907 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6751  Osmosensitive K channel His kinase sensor  36.86 
 
 
902 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5839  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
902 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243698  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 
895 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4648  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 
900 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1673  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
947 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122182  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2285  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
947 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2308  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
947 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.48 
 
 
887 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5612  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 
947 aa  382  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162151  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2054  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
949 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414922  normal  0.736885 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1311  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
944 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.162113 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5361  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
897 aa  382  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0303077 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.48 
 
 
887 aa  382  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  34.89 
 
 
895 aa  372  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3236  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  46.43 
 
 
900 aa  372  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.734401  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1099  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
896 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1087  sensor protein KdpD  36.13 
 
 
954 aa  369  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2201  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
945 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394396  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0780  sensor histidine kinase KdpD  36.13 
 
 
954 aa  369  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.795165  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6071  two component sensor kinase  34.74 
 
 
902 aa  363  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1465  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 
895 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.113581  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2323  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
945 aa  363  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1667  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
897 aa  362  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0713  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 
867 aa  361  4e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0993  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
951 aa  357  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3493  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 
867 aa  356  8.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.789076  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
902 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3637  two-component sensor KdpD  35.9 
 
 
885 aa  349  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  35.36 
 
 
906 aa  349  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1080  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
902 aa  348  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.987638  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3730  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
884 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2991  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 
894 aa  345  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2290  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
951 aa  345  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.014043  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2050  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
887 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2245  sensor protein KdpD  35.21 
 
 
887 aa  344  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43350  two-component sensor KdpD  35.15 
 
 
885 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.619422  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4158  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
884 aa  340  7e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930921  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1710  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
884 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3385  two-component sensor kinase KDPD transcription regulator protein  34.03 
 
 
937 aa  336  9e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0896  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  36.68 
 
 
658 aa  334  4e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000123785 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  32.57 
 
 
908 aa  333  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  32.7 
 
 
908 aa  332  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  32.45 
 
 
908 aa  331  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2930  sensor protein KdpD  34.5 
 
 
909 aa  331  4e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.770189  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3601  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
899 aa  330  7e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5921  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 
904 aa  329  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4030  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
883 aa  328  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2695  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.89 
 
 
897 aa  326  8.000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0787652  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3483  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
884 aa  326  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  34.33 
 
 
910 aa  323  6e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2229  sensor histidine kinase KdpD  34.87 
 
 
913 aa  323  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1884  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
913 aa  323  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0390049  normal  0.40253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>