More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1025 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1025  threonine dehydrogenase and related Zn-dependent dehydrogenases-like protein  100 
 
 		 125 aa  253  7e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0880  alcohol dehydrogenase  77.27 
 
 		 351 aa  171  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173388  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3625  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.71 
 
 		 358 aa  144  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00723934  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07590  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  60.71 
 
 		 357 aa  140  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0784  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  63.64 
 
 		 353 aa  140  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2959  alcohol dehydrogenase  55 
 
 		 373 aa  130  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2380  alcohol dehydrogenase  54.55 
 
 		 354 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209062 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2069  alcohol dehydrogenase  53.64 
 
 		 352 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1092  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.87 
 
 		 351 aa  107  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.73 
 
 		 354 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  42.73 
 
 		 365 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  41.82 
 
 		 354 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  40.91 
 
 		 354 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  40 
 
 		 354 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40 
 
 		 354 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  40 
 
 		 364 aa  88.6  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  39.09 
 
 		 363 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  38.18 
 
 		 363 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  36.36 
 
 		 362 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 		 362 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  36.36 
 
 		 360 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 		 362 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.82 
 
 		 350 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.59 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  40.2 
 
 		 350 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2976  alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 		 358 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.08 
 
 		 347 aa  72  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  34.23 
 
 		 355 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.78 
 
 		 350 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.78 
 
 		 350 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  35.78 
 
 		 350 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  35.78 
 
 		 350 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.78 
 
 		 350 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.78 
 
 		 350 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  35.78 
 
 		 350 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  36.19 
 
 		 353 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4034  alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.86 
 
 		 350 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 		 350 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.86 
 
 		 350 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5456  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.63 
 
 		 343 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.077084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5853  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 		 343 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00833857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  36.04 
 
 		 353 aa  67.8  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09288  conserved hypothetical protein  35.29 
 
 		 382 aa  67.8  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  34.58 
 
 		 352 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0638  alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 		 343 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1641  alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 		 343 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1668  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 		 343 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1692  alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 		 343 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0556  alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 		 343 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0527  alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 		 343 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.25 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4980  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.155342 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2217  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 		 357 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  34.31 
 
 		 348 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00599  conserved hypothetical protein  33.93 
 
 		 369 aa  64.7  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.932146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0849  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 		 344 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0438742 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 		 356 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  31.82 
 
 		 352 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.99 
 
 		 346 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0912  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  33.33 
 
 		 349 aa  64.3  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00151014  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7649  zinc-binding dehydrogenase  32.08 
 
 		 357 aa  63.5  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.298467  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1700  threonine dehydrogenase  34.29 
 
 		 346 aa  63.5  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.333284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  33.33 
 
 		 352 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  27.12 
 
 		 360 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 		 341 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 		 341 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 		 341 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 		 341 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 		 341 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 		 341 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 		 341 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  32.73 
 
 		 341 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.33 
 
 		 351 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  31.82 
 
 		 343 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  28.33 
 
 		 351 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 		 344 aa  60.5  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.41 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 		 373 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5833  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.48 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.119386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  33.01 
 
 		 346 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.91 
 
 		 373 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 		 373 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1713  alcohol dehydrogenase  30.1 
 
 		 343 aa  58.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  32.56 
 
 		 343 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2163  alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 		 345 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.91 
 
 		 373 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  30.19 
 
 		 373 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6662  alcohol dehydrogenase  29.25 
 
 		 344 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.838814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  32.04 
 
 		 346 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.72 
 
 		 351 aa  57.8  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.09 
 
 		 343 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.83 
 
 		 344 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.25 
 
 		 341 aa  57  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 370 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.11 
 
 		 346 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.21 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4040  alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0364126 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  29.25 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>