36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6559 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6559  dienelactone hydrolase-like protein  100 
 
 
270 aa  523  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04550  dienelactone hydrolase-like enzyme  56.41 
 
 
278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0809694 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1138  hypothetical protein  44.9 
 
 
287 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1155  hypothetical protein  44.9 
 
 
287 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0655389  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1165  hypothetical protein  44.9 
 
 
287 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746782  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0876  hypothetical protein  40.84 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4940  hypothetical protein  43.14 
 
 
284 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.204789  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1179  dienelactone hydrolase  44.15 
 
 
286 aa  178  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.401039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1479  hypothetical protein  42.4 
 
 
281 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.909184 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13475  hypothetical protein  44.3 
 
 
280 aa  159  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000130156  hitchhiker  0.00071947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1708  hypothetical protein  39.56 
 
 
315 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6636  hypothetical protein  36.61 
 
 
301 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1868  Triacylglycerol lipase  26.36 
 
 
319 aa  50.4  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.021332  normal  0.0911205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  30.59 
 
 
297 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  24.36 
 
 
547 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  29.48 
 
 
319 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  30.77 
 
 
524 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.34 
 
 
370 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0776  peptidase S15  35.58 
 
 
517 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  31.87 
 
 
381 aa  46.6  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.91 
 
 
361 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1278  Triacylglycerol lipase  28.37 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  30.19 
 
 
316 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5476  hypothetical protein  31.11 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.0121442 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2009  dienelactone hydrolase  32.82 
 
 
310 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  27.33 
 
 
301 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  30.22 
 
 
336 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  38.24 
 
 
472 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  28.49 
 
 
275 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0390  Triacylglycerol lipase  36.46 
 
 
292 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0658  hypothetical protein  25.45 
 
 
313 aa  43.5  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000360188  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3830  Triacylglycerol lipase  37.33 
 
 
298 aa  42.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0300878  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  30.18 
 
 
300 aa  42.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16100  hypothetical protein  27.59 
 
 
406 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 
290 aa  42.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  29.44 
 
 
309 aa  42  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>