218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4193 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07388  Catalase-peroxidase (CP)(EC 1.11.1.6)(EC 1.11.1.7)(Peroxidase/catalase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96VT4]  62.29 
 
 
739 aa  900    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11937  catalase-peroxidase katG  67.99 
 
 
740 aa  968    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1851  catalase/peroxidase HPI  67.13 
 
 
728 aa  973    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03828  catalase/hydroperoxidase HPI(I)  58.8 
 
 
726 aa  811    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4043  catalase/peroxidase HPI  58.66 
 
 
726 aa  809    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2100  catalase/peroxidase  68.07 
 
 
727 aa  951    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.407281  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3668  catalase/peroxidase HPI  65.65 
 
 
751 aa  955    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0509082  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10808  catalase/peroxidase  61.1 
 
 
740 aa  913    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.661719  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1585  catalase/peroxidase HPI  66.62 
 
 
737 aa  1021    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1344  catalase/peroxidase HPI  60.17 
 
 
740 aa  873    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0725  catalase/peroxidase HPI  58.96 
 
 
741 aa  827    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4405  catalase/peroxidase HPI  58.42 
 
 
728 aa  863    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4530  catalase/peroxidase HPI  67.42 
 
 
756 aa  1004    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2391  catalase/peroxidase HPI  70.11 
 
 
728 aa  1019    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.347658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0252  catalase-peroxidase  62.62 
 
 
749 aa  933    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2454  catalase-peroxidase KatB  57.22 
 
 
721 aa  827    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0250  catalase-peroxidase  61.16 
 
 
749 aa  926    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2313  catalase-peroxidase KatB  57.63 
 
 
721 aa  838    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1166  catalase/peroxidase  59.51 
 
 
724 aa  871    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.801479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3881  catalase/peroxidase HPI  62 
 
 
716 aa  861    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4208  haem catalase/peroxidase  67.68 
 
 
756 aa  1007    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260904  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3836  heme catalase/peroxidase  66.85 
 
 
736 aa  903    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141049  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1635  heme catalase/peroxidase  64.88 
 
 
751 aa  922    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1741  heme catalase/peroxidase  69.99 
 
 
728 aa  1008    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0030  haem catalase/peroxidase  67.62 
 
 
729 aa  983    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.187858 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3366  catalase/peroxidase HPI  70.25 
 
 
728 aa  1021    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.336723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2201  haem catalase/peroxidase  66.98 
 
 
755 aa  1013    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1175  catalase/peroxidase HPI  64.95 
 
 
739 aa  965    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3814  haem catalase/peroxidase  68.9 
 
 
728 aa  1000    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915162  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0386  haem catalase/peroxidase  65.39 
 
 
733 aa  1000    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0181  catalase/peroxidase HPI  59.89 
 
 
729 aa  823    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.877422  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1656  catalase/peroxidase HPI  59.95 
 
 
720 aa  874    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1282  catalase/peroxidase HPI  69.82 
 
 
728 aa  1029    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1918  catalase/peroxidase HPI  73.92 
 
 
744 aa  1131    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0108605  normal  0.336609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0610  catalase/peroxidase HPI  66.62 
 
 
732 aa  955    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2909  catalase/peroxidase HPI  63.6 
 
 
747 aa  859    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2433  catalase/peroxidase HPI  68.81 
 
 
718 aa  1010    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1586  catalase/peroxidase HPI  60.62 
 
 
735 aa  894    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.711142  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3888  catalase  58.05 
 
 
738 aa  845    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.691403  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0361  catalase/peroxidase HPI  68.67 
 
 
732 aa  991    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0678  catalase/peroxidase HPI  70.48 
 
 
731 aa  1049    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.627364  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0772  haem catalase/peroxidase  65.65 
 
 
753 aa  962    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.468633  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1384  catalase/peroxidase HPI  55.85 
 
 
720 aa  829    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0223  catalase/peroxidase HPI  67.12 
 
 
732 aa  958    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0159  catalase/peroxidase HPI  55.07 
 
 
717 aa  793    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0037  catalase/peroxidase HPI  66.67 
 
 
729 aa  969    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539585  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5371  catalase/hydroperoxidase HPI(I)  68 
 
 
726 aa  968    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849549  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1356  catalase/peroxidase HPI  67.72 
 
 
752 aa  1002    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2791  catalase/peroxidase HPI  62.55 
 
 
738 aa  931    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2146  catalase/peroxidase HPI  56.6 
 
 
731 aa  783    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.423847  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0242  catalase/peroxidase HPI  69.68 
 
 
728 aa  1011    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.698456  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3169  catalase/peroxidase HPI  69.01 
 
 
728 aa  979    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2682  catalase/peroxidase HPI  62.89 
 
 
749 aa  919    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.463482  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1975  catalase/peroxidase HPI  59.58 
 
 
753 aa  861    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0626  catalase/peroxidase HPI  69.74 
 
 
726 aa  1011    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5331  catalase/peroxidase HPI  66.71 
 
 
729 aa  979    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.850303  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4032  catalase/peroxidase HPI  58.2 
 
 
726 aa  811    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3897  catalase/peroxidase HPI  65.69 
 
 
757 aa  972    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0311  catalase/peroxidase HPI  59.35 
 
 
728 aa  884    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3379  catalase/peroxidase HPI  58.87 
 
 
739 aa  864    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0574  catalase/peroxidase HPI  60.08 
 
 
739 aa  865    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3713  catalase/peroxidase HPI  59.35 
 
 
728 aa  863    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1522  catalase/peroxidase HPI  58.53 
 
 
723 aa  853    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.329951  normal  0.447043 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1917  catalase/peroxidase HPI  58.22 
 
 
738 aa  850    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.151995  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3122  catalase/peroxidase HPI  58.27 
 
 
757 aa  828    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2686  catalase/peroxidase HPI  55.86 
 
 
724 aa  775    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0616  catalase/peroxidase HPI  69.59 
 
 
728 aa  1006    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.246482  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5842  catalase/peroxidase HPI  61.21 
 
 
741 aa  843    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0726  catalase/peroxidase HPI  69.68 
 
 
728 aa  1011    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5199  catalase/peroxidase HPI  69.01 
 
 
728 aa  979    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0332501 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0306  catalase/peroxidase HPI  59.21 
 
 
728 aa  847    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.20325 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3549  catalase/peroxidase HPI  58.73 
 
 
739 aa  863    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1387  catalase/peroxidase HPI  65.16 
 
 
736 aa  934    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0755  catalase/peroxidase HPI  64.67 
 
 
732 aa  935    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0577026  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2497  catalase/peroxidase HPI  56.27 
 
 
725 aa  806    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0875  catalase/peroxidase HPI  65.28 
 
 
760 aa  930    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0745  catalase  59.22 
 
 
738 aa  885    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3270  catalase  57.01 
 
 
718 aa  825    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2727  catalase/peroxidase HPI  62.89 
 
 
749 aa  919    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2142  catalase/peroxidase HPI  57.26 
 
 
724 aa  852    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.501664  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2984  catalase/peroxidase HPI  63.02 
 
 
737 aa  926    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156049  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3208  catalase/peroxidase HPI  62.94 
 
 
747 aa  917    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.996485  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1056  catalase/peroxidase HPI  55.62 
 
 
723 aa  804    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3132  catalase/peroxidase HPI  65.91 
 
 
743 aa  968    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0936782  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0308  catalase/peroxidase HPI  70.11 
 
 
728 aa  1019    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0547  catalase/peroxidase HPI  58.72 
 
 
724 aa  847    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.474968  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3740  catalase  65.06 
 
 
715 aa  915    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1169  catalase/peroxidase HPI  70.11 
 
 
728 aa  1019    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6389  catalase  68.36 
 
 
726 aa  991    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0415  catalase/peroxidase HPI  59.16 
 
 
728 aa  888    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0875  catalase/peroxidase HPI  65.75 
 
 
721 aa  972    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00113495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3322  catalase/peroxidase HPI  70.11 
 
 
728 aa  1019    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3356  catalase/peroxidase HPI  70.11 
 
 
728 aa  1019    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0335715  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2713  catalase/peroxidase HPI  62.89 
 
 
749 aa  919    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.451958 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2578  catalase/peroxidase HPI  70.11 
 
 
728 aa  1019    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0709  catalase/peroxidase HPI  58.42 
 
 
756 aa  813    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3451  catalase/peroxidase HPI  63.87 
 
 
748 aa  929    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3306  hypothetical protein  58.58 
 
 
724 aa  826    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.706262  normal  0.467266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2061  catalase/peroxidase HPI  65.52 
 
 
751 aa  955    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2044  catalase/peroxidase HPI  56.46 
 
 
717 aa  828    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.73931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>