More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1010 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1010  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  100 
 
 		 329 aa  631  1e-180  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1443  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.44 
 
 		 331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  50.94 
 
 		 328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2319  putative quinone oxidoreductase  53.23 
 
 		 328 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.721374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  52.63 
 
 		 326 aa  301  9e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  50.47 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0556  alcohol dehydrogenase  51.23 
 
 		 328 aa  300  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.78 
 
 		 336 aa  298  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.84 
 
 		 328 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0467  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.61 
 
 		 325 aa  297  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  52.92 
 
 		 330 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.16 
 
 		 327 aa  296  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  49.53 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.06 
 
 		 328 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50 
 
 		 328 aa  293  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1984  alcohol dehydrogenase  47.55 
 
 		 327 aa  292  5e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.06 
 
 		 345 aa  292  5e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  51.38 
 
 		 331 aa  292  5e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  50.46 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  50.32 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0250  alcohol dehydrogenase  45.51 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  44.92 
 
 		 327 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.47 
 
 		 328 aa  289  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0254  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.89 
 
 		 326 aa  288  7e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2933  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  51.69 
 
 		 332 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0318941 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0082  alcohol dehydrogenase  48.92 
 
 		 326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0838693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.92 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  51.54 
 
 		 327 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0255  quinone oxidoreductase  45.2 
 
 		 326 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1434  putative Zn-dependent oxidoreductase  48.62 
 
 		 326 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0252  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  44.89 
 
 		 326 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1229  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.38 
 
 		 342 aa  285  9e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.157055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1185  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.31 
 
 		 327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1314  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.23 
 
 		 336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0952218  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1416  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.23 
 
 		 336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2767  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.38 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0766  alcohol dehydrogenase  46.01 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.77 
 
 		 327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3530  alcohol dehydrogenase  43.03 
 
 		 326 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2753  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.99 
 
 		 327 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700456  normal  0.0252326 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1419  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.93 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2891  putative oxidoreductase protein  48.08 
 
 		 338 aa  281  9e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0272  quinone oxidoreductase  45.2 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0260  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.71 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2475  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.04 
 
 		 329 aa  281  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1052  quinone oxidoreductase  48.15 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.2 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3572  alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 		 326 aa  280  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3133  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.2 
 
 		 338 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.87638 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.69 
 
 		 327 aa  279  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.4 
 
 		 327 aa  278  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  45.31 
 
 		 324 aa  278  7e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3356  quinone oxidoreductase  48.15 
 
 		 327 aa  278  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0638936 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  45.31 
 
 		 324 aa  278  7e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  45 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2968  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  45.71 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0338214  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2962  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.46 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3519  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.16 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.231356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1210  alcohol dehydrogenase  47.83 
 
 		 328 aa  277  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783737  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.24 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  45 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3285  quinone oxidoreductase, YhdH family  45 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00682496  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2939  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.63 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  45 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0271  alcohol dehydrogenase  46.13 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2154  alcohol dehydrogenase  43.3 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.573953  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  51.1 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  48 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  45 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2231  alcohol dehydrogenase  43.3 
 
 		 326 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499373  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  48 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001990  alcohol dehydrogenase  44.58 
 
 		 326 aa  276  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3700  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  50.16 
 
 		 327 aa  275  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2634  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.11 
 
 		 325 aa  275  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  45 
 
 		 324 aa  275  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3941  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  44.58 
 
 		 326 aa  275  7e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.47 
 
 		 334 aa  275  8e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1223  quinone oxidoreductase  48.88 
 
 		 328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00458  alcohol dehydrogenase  44.58 
 
 		 326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3189  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.11 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  48.62 
 
 		 329 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2378  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.59 
 
 		 334 aa  272  5.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.648384 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5461  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48 
 
 		 327 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5401  alcohol dehydrogenase  48 
 
 		 327 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2517  putative zinc-binding dehydrogenase  48.87 
 
 		 326 aa  272  6e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.145021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24770  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  50.46 
 
 		 328 aa  272  7e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  50.68 
 
 		 330 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6131  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.19 
 
 		 331 aa  271  9e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1248  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.06 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1474  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.82 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  45.37 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1602  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.01 
 
 		 327 aa  270  4e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1204  quinone oxidoreductase  46.63 
 
 		 326 aa  269  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.740135  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1893  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.12 
 
 		 327 aa  269  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1341  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.64 
 
 		 330 aa  268  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000434756  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4748  oxidoreductase, zinc-binding  42.02 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4869  quinone oxidoreductase  47.69 
 
 		 327 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.578327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3639  hypothetical protein  44.58 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000530088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>