29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3225 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3225  hypothetical protein  100 
 
 
485 aa  992    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4350  hypothetical protein  33.33 
 
 
510 aa  251  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.278598  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1793  hypothetical protein  32.59 
 
 
396 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2090  hypothetical protein  33.83 
 
 
390 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.637771  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4859  hypothetical protein  27.86 
 
 
549 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000408523  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1803  hypothetical protein  24.17 
 
 
454 aa  110  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6933  hypothetical protein  28.92 
 
 
403 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2345  hypothetical protein  26.3 
 
 
416 aa  101  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333992  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0135  hypothetical protein  26.8 
 
 
417 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2822  hypothetical protein  25.77 
 
 
449 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.816333  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1541  hypothetical protein  27.59 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.615307 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0094  hypothetical protein  27.13 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1587  hypothetical protein  23.33 
 
 
415 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal  0.665327 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0112  hypothetical protein  22.8 
 
 
478 aa  72.4  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000000224966  decreased coverage  0.000517302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0550  hypothetical protein  26.15 
 
 
415 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2294  hypothetical protein  23.97 
 
 
415 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861747  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1232  hypothetical protein  24.58 
 
 
440 aa  65.1  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.583385  normal  0.276368 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0945  hypothetical protein  40.48 
 
 
423 aa  64.3  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523813  n/a   
 
 
 
NC_009077  Mjls_3186  hypothetical protein  22.09 
 
 
337 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3236  hypothetical protein  22.09 
 
 
337 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3174  hypothetical protein  22.09 
 
 
337 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2053  hypothetical protein  20.8 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  hitchhiker  0.000642876 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4659  hypothetical protein  25.11 
 
 
468 aa  53.5  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7322  hypothetical protein  24.42 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.33936  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2084  hypothetical protein  36.36 
 
 
434 aa  50.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0757382  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_50  hypothetical protein  38.36 
 
 
424 aa  50.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00190835  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06330  hypothetical protein  21.09 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0752  hypothetical protein  26.06 
 
 
428 aa  48.5  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000194226 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1775  hypothetical protein  28.8 
 
 
453 aa  43.5  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>