23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2090 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2090  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  813    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.637771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3225  hypothetical protein  33.83 
 
 		 485 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1793  hypothetical protein  32.1 
 
 		 396 aa  146  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0094  hypothetical protein  28.64 
 
 		 415 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0135  hypothetical protein  30.66 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4859  hypothetical protein  31.41 
 
 		 549 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000408523  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6933  hypothetical protein  32.19 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4350  hypothetical protein  28.93 
 
 		 510 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.278598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2345  hypothetical protein  30.47 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333992  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1541  hypothetical protein  30.62 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.615307 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3236  hypothetical protein  24.05 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3186  hypothetical protein  24.05 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3174  hypothetical protein  24.05 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1587  hypothetical protein  24.31 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal  0.665327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0550  hypothetical protein  22.79 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06330  hypothetical protein  23.77 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2294  hypothetical protein  20.82 
 
 		 415 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1232  hypothetical protein  25.59 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.583385  normal  0.276368 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1803  hypothetical protein  20.25 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2217  hypothetical protein  24.88 
 
 		 304 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.529623  normal  0.381396 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0355  hypothetical protein  22.04 
 
 		 372 aa  47  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2822  hypothetical protein  21.53 
 
 		 449 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.816333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0112  hypothetical protein  22.15 
 
 		 478 aa  42.7  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000000224966  decreased coverage  0.000517302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>