29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1803 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1803  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  946    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0112  hypothetical protein  34.09 
 
 		 478 aa  265  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000000224966  decreased coverage  0.000517302 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06330  hypothetical protein  37.3 
 
 		 330 aa  206  7e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3174  hypothetical protein  35.19 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3186  hypothetical protein  35.19 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3236  hypothetical protein  35.19 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2053  hypothetical protein  35.16 
 
 		 336 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  hitchhiker  0.000642876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2822  hypothetical protein  23.99 
 
 		 449 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.816333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4350  hypothetical protein  25.74 
 
 		 510 aa  107  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.278598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3225  hypothetical protein  23.03 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1739  hypothetical protein  22.15 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4859  hypothetical protein  23.55 
 
 		 549 aa  69.7  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000408523  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0945  hypothetical protein  33.02 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523813  n/a   
 
 
 
NC_011662  Tmz1t_2084  hypothetical protein  26.61 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0757382  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0752  hypothetical protein  26.67 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000194226 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_50  hypothetical protein  27.69 
 
 		 424 aa  59.7  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00190835  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2331  hypothetical protein  23.5 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122664  hitchhiker  0.0000000213226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4659  hypothetical protein  23.72 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1541  hypothetical protein  27.52 
 
 		 415 aa  53.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.615307 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1775  hypothetical protein  22.65 
 
 		 453 aa  50.1  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2090  hypothetical protein  20.25 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.637771  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2345  hypothetical protein  21 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333992  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1793  hypothetical protein  20.5 
 
 		 396 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1587  hypothetical protein  24.75 
 
 		 415 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal  0.665327 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1832  hypothetical protein  20.28 
 
 		 442 aa  47  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0094  hypothetical protein  24.24 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0135  hypothetical protein  20.93 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0550  hypothetical protein  34.18 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2294  hypothetical protein  32.91 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>