31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4859 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4859  hypothetical protein  100 
 
 
549 aa  1139    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000408523  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3225  hypothetical protein  28.7 
 
 
485 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2090  hypothetical protein  31.41 
 
 
390 aa  137  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.637771  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4350  hypothetical protein  28.53 
 
 
510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.278598  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1793  hypothetical protein  26.08 
 
 
396 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0550  hypothetical protein  24.41 
 
 
415 aa  95.9  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0135  hypothetical protein  29.35 
 
 
417 aa  94  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2345  hypothetical protein  30.55 
 
 
416 aa  93.2  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333992  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2294  hypothetical protein  24.27 
 
 
415 aa  90.1  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861747  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6933  hypothetical protein  23.47 
 
 
403 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1587  hypothetical protein  24.79 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal  0.665327 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3186  hypothetical protein  26.09 
 
 
337 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3236  hypothetical protein  26.09 
 
 
337 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3174  hypothetical protein  26.09 
 
 
337 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1740  hypothetical protein  40.4 
 
 
146 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.792895  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06330  hypothetical protein  25.22 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0553  hypothetical protein  25.06 
 
 
432 aa  73.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.844631 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1803  hypothetical protein  23.55 
 
 
454 aa  69.7  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2822  hypothetical protein  27.59 
 
 
449 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.816333  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1541  hypothetical protein  28.33 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.615307 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0094  hypothetical protein  28.57 
 
 
415 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1232  hypothetical protein  23.02 
 
 
440 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.583385  normal  0.276368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0554  hypothetical protein  34.71 
 
 
164 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238439  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0549  hypothetical protein  37.5 
 
 
150 aa  61.2  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7322  hypothetical protein  24.29 
 
 
413 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.33936  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0112  hypothetical protein  22.47 
 
 
478 aa  58.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000000224966  decreased coverage  0.000517302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2293  hypothetical protein  35.23 
 
 
136 aa  57.4  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2089  hypothetical protein  30.48 
 
 
141 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117694  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1540  hypothetical protein  36.92 
 
 
160 aa  50.4  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.712967  normal  0.573088 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4247  hypothetical protein  28.72 
 
 
160 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.356623  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1231  hypothetical protein  47.17 
 
 
163 aa  47.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231213  normal  0.21928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>