19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4659 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4659  hypothetical protein  100 
 
 
468 aa  970    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1775  hypothetical protein  30.02 
 
 
453 aa  179  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2213  hypothetical protein  27.09 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.101715  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2217  hypothetical protein  28.29 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.529623  normal  0.381396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5143  hypothetical protein  28.42 
 
 
393 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1319  hypothetical protein  28.57 
 
 
345 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13910  hypothetical protein  26.04 
 
 
315 aa  60.1  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4664  hypothetical protein  25.22 
 
 
380 aa  57  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201323  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2822  hypothetical protein  25.06 
 
 
449 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.816333  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1803  hypothetical protein  23.72 
 
 
454 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1373  hypothetical protein  28.57 
 
 
434 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3225  hypothetical protein  25.11 
 
 
485 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4355  hypothetical protein  27.35 
 
 
343 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3186  hypothetical protein  29.65 
 
 
337 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3236  hypothetical protein  29.65 
 
 
337 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3174  hypothetical protein  29.65 
 
 
337 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0135  hypothetical protein  24.63 
 
 
417 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0752  hypothetical protein  26.09 
 
 
428 aa  45.8  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000194226 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6933  hypothetical protein  25.69 
 
 
403 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>