18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6933 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6933  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  834    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2090  hypothetical protein  32.19 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.637771  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0135  hypothetical protein  28.66 
 
 
417 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2345  hypothetical protein  29.25 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333992  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3225  hypothetical protein  28.92 
 
 
485 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1793  hypothetical protein  29.69 
 
 
396 aa  94.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0094  hypothetical protein  28.57 
 
 
415 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4350  hypothetical protein  26.16 
 
 
510 aa  86.3  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.278598  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4859  hypothetical protein  23.47 
 
 
549 aa  83.2  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000408523  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1541  hypothetical protein  27.27 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.615307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2294  hypothetical protein  24.3 
 
 
415 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861747  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06330  hypothetical protein  21.23 
 
 
330 aa  53.5  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0550  hypothetical protein  25.15 
 
 
415 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3236  hypothetical protein  21.36 
 
 
337 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3186  hypothetical protein  21.36 
 
 
337 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3174  hypothetical protein  21.36 
 
 
337 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7322  hypothetical protein  29.1 
 
 
413 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.33936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4659  hypothetical protein  25.69 
 
 
468 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>