12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_7322 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007490  RSP_7322  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  850    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.33936  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0553  hypothetical protein  40.1 
 
 
432 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.844631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1587  hypothetical protein  30.3 
 
 
415 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal  0.665327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2294  hypothetical protein  30.02 
 
 
415 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861747  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0550  hypothetical protein  29.23 
 
 
415 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1232  hypothetical protein  26.58 
 
 
440 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.583385  normal  0.276368 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4859  hypothetical protein  24.94 
 
 
549 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000408523  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3225  hypothetical protein  24.42 
 
 
485 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0135  hypothetical protein  25.47 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6933  hypothetical protein  29.1 
 
 
403 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1541  hypothetical protein  32.82 
 
 
415 aa  47.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.615307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1793  hypothetical protein  24.11 
 
 
396 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.14335 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>