12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1232 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1232  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  901    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.583385  normal  0.276368 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1587  hypothetical protein  35.26 
 
 		 415 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal  0.665327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2294  hypothetical protein  29.63 
 
 		 415 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0550  hypothetical protein  29.38 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0553  hypothetical protein  27.79 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.844631 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7322  hypothetical protein  25.43 
 
 		 413 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.33936  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4350  hypothetical protein  24.23 
 
 		 510 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.278598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4859  hypothetical protein  23.02 
 
 		 549 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000408523  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3225  hypothetical protein  25.08 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1793  hypothetical protein  21.7 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2090  hypothetical protein  21.79 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.637771  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1541  hypothetical protein  23.31 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.615307 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>