19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1793 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1793  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  827    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3225  hypothetical protein  32.59 
 
 		 485 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4350  hypothetical protein  31.9 
 
 		 510 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.278598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2090  hypothetical protein  32.1 
 
 		 390 aa  146  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.637771  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4859  hypothetical protein  26.08 
 
 		 549 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000408523  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2345  hypothetical protein  26.47 
 
 		 416 aa  99  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333992  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6933  hypothetical protein  29.69 
 
 		 403 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0135  hypothetical protein  25.71 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1232  hypothetical protein  21.11 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.583385  normal  0.276368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2822  hypothetical protein  21.24 
 
 		 449 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.816333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0550  hypothetical protein  23.89 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0094  hypothetical protein  25.09 
 
 		 415 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1803  hypothetical protein  20.5 
 
 		 454 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06330  hypothetical protein  22.5 
 
 		 330 aa  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2294  hypothetical protein  24.47 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7322  hypothetical protein  24.11 
 
 		 413 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.33936  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3186  hypothetical protein  22.61 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3236  hypothetical protein  22.61 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3174  hypothetical protein  22.61 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>