18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2294 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2294  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  853    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0550  hypothetical protein  93.49 
 
 		 415 aa  776    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1587  hypothetical protein  35.24 
 
 		 415 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal  0.665327 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1232  hypothetical protein  30.12 
 
 		 440 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.583385  normal  0.276368 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7322  hypothetical protein  29.82 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.33936  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0553  hypothetical protein  29.07 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.844631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4859  hypothetical protein  25 
 
 		 549 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000408523  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3225  hypothetical protein  24.94 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2090  hypothetical protein  22.06 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.637771  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4350  hypothetical protein  22.98 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.278598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6933  hypothetical protein  24.3 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1793  hypothetical protein  25.08 
 
 		 396 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1541  hypothetical protein  23.52 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.615307 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06330  hypothetical protein  30.82 
 
 		 330 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3236  hypothetical protein  28.86 
 
 		 337 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3186  hypothetical protein  28.86 
 
 		 337 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3174  hypothetical protein  28.86 
 
 		 337 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1803  hypothetical protein  32.91 
 
 		 454 aa  43.1  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>