21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3174 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3174  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  704    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3236  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  704    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3186  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  704    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06330  hypothetical protein  79.82 
 
 
330 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2053  hypothetical protein  57.02 
 
 
336 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  hitchhiker  0.000642876 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1803  hypothetical protein  35.19 
 
 
454 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0112  hypothetical protein  32.74 
 
 
478 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000000224966  decreased coverage  0.000517302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4859  hypothetical protein  26.09 
 
 
549 aa  76.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000408523  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3225  hypothetical protein  22.09 
 
 
485 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2090  hypothetical protein  24.05 
 
 
390 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.637771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2822  hypothetical protein  22.06 
 
 
449 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.816333  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1775  hypothetical protein  29.58 
 
 
453 aa  53.1  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13910  hypothetical protein  28.75 
 
 
315 aa  52  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6933  hypothetical protein  21.36 
 
 
403 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1541  hypothetical protein  26.14 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.615307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4659  hypothetical protein  29.65 
 
 
468 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0550  hypothetical protein  28.38 
 
 
415 aa  46.6  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1739  hypothetical protein  22.87 
 
 
358 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1793  hypothetical protein  22.61 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2294  hypothetical protein  28.86 
 
 
415 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861747  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0094  hypothetical protein  23.11 
 
 
415 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>