17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0094 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0094  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  847    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1541  hypothetical protein  49.76 
 
 
415 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.615307 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2090  hypothetical protein  28.99 
 
 
390 aa  143  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.637771  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6933  hypothetical protein  28.78 
 
 
403 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3225  hypothetical protein  28.16 
 
 
485 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4859  hypothetical protein  28.57 
 
 
549 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000408523  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0135  hypothetical protein  27.16 
 
 
417 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4350  hypothetical protein  25.68 
 
 
510 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.278598  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2345  hypothetical protein  27.05 
 
 
416 aa  65.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333992  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1793  hypothetical protein  25.56 
 
 
396 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1803  hypothetical protein  24.24 
 
 
454 aa  51.6  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1587  hypothetical protein  24.45 
 
 
415 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal  0.665327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3174  hypothetical protein  23.11 
 
 
337 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3236  hypothetical protein  23.11 
 
 
337 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3186  hypothetical protein  23.11 
 
 
337 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2294  hypothetical protein  22 
 
 
415 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861747  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0550  hypothetical protein  22.19 
 
 
415 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>