14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0112 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0112  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  988    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000000224966  decreased coverage  0.000517302 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1803  hypothetical protein  34.09 
 
 		 454 aa  265  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06330  hypothetical protein  35.2 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3174  hypothetical protein  32.74 
 
 		 337 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3236  hypothetical protein  32.74 
 
 		 337 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3186  hypothetical protein  32.74 
 
 		 337 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2053  hypothetical protein  32.13 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  hitchhiker  0.000642876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2822  hypothetical protein  23.98 
 
 		 449 aa  107  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.816333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3225  hypothetical protein  22.6 
 
 		 485 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4859  hypothetical protein  22.47 
 
 		 549 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000408523  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1739  hypothetical protein  19.38 
 
 		 358 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1541  hypothetical protein  27.52 
 
 		 415 aa  47  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.615307 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1775  hypothetical protein  26.51 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2217  hypothetical protein  24.27 
 
 		 304 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.529623  normal  0.381396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>