23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2331 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2331  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  879    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122664  hitchhiker  0.0000000213226 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_50  hypothetical protein  44.96 
 
 		 424 aa  352  5.9999999999999994e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00190835  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2084  hypothetical protein  40.74 
 
 		 434 aa  316  5e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0757382  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0752  hypothetical protein  38.55 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000194226 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1515  hypothetical protein  42.18 
 
 		 293 aa  219  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.107108  hitchhiker  0.0038288 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0384  hypothetical protein  42.18 
 
 		 293 aa  219  6e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288726 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0945  hypothetical protein  30.9 
 
 		 423 aa  188  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523813  n/a   
 
 
 
NC_010803  Clim_1034  hypothetical protein  36.73 
 
 		 292 aa  176  7e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02900  hypothetical protein  35.86 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00646507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1036  hypothetical protein  33.22 
 
 		 294 aa  162  9e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1803  hypothetical protein  23.5 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1832  hypothetical protein  32.43 
 
 		 442 aa  53.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539757  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6748  DNA polymerase, beta-like region  21.38 
 
 		 321 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1739  hypothetical protein  20.91 
 
 		 358 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2454  hypothetical protein  23.03 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000139037  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4350  hypothetical protein  31.76 
 
 		 510 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.278598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3227  hypothetical protein  32.8 
 
 		 490 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.999144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6926  DNA polymerase beta domain protein region  26.47 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000143596  hitchhiker  0.000343004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1233  hypothetical protein  22.27 
 
 		 283 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7308  hypothetical protein  25.68 
 
 		 288 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000749019  hitchhiker  0.0000983885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2372  hypothetical protein  21.97 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5161  hypothetical protein  21.99 
 
 		 301 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0502601  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2822  hypothetical protein  19.58 
 
 		 449 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.816333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>