22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1233 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1233  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  590  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5161  hypothetical protein  25.57 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0502601  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1829  hypothetical protein  25.42 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.660383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6926  DNA polymerase beta domain protein region  27.7 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000143596  hitchhiker  0.000343004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7308  hypothetical protein  24.71 
 
 		 288 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000749019  hitchhiker  0.0000983885 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0222  hypothetical protein  23.97 
 
 		 363 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4359  hypothetical protein  23.97 
 
 		 365 aa  82.4  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687672  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2340  hypothetical protein  24.18 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000406719  unclonable  0.000000155562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1270  hypothetical protein  24.18 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1515  hypothetical protein  26.49 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.107108  hitchhiker  0.0038288 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0384  hypothetical protein  26.16 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3227  hypothetical protein  26.87 
 
 		 490 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.999144  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0665  hypothetical protein  21.38 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02900  hypothetical protein  25.35 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00646507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_50  hypothetical protein  23.45 
 
 		 424 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00190835  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1034  hypothetical protein  20.67 
 
 		 292 aa  49.3  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0752  hypothetical protein  25 
 
 		 428 aa  48.5  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000194226 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0945  hypothetical protein  23.93 
 
 		 423 aa  48.5  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523813  n/a   
 
 
 
NC_011205  SeD_A2331  hypothetical protein  22.27 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122664  hitchhiker  0.0000000213226 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2084  hypothetical protein  21.97 
 
 		 434 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0757382  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6748  DNA polymerase, beta-like region  23.48 
 
 		 321 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2822  hypothetical protein  20.08 
 
 		 449 aa  45.8  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.816333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>