19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0384 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0384  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  612  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.288726 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1515  hypothetical protein  97.95 
 
 
293 aa  603  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.107108  hitchhiker  0.0038288 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1034  hypothetical protein  51.19 
 
 
292 aa  301  7.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02900  hypothetical protein  45.89 
 
 
296 aa  272  5.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00646507  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2084  hypothetical protein  44.52 
 
 
434 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0757382  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2331  hypothetical protein  42.18 
 
 
423 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122664  hitchhiker  0.0000000213226 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1036  hypothetical protein  36.64 
 
 
294 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_50  hypothetical protein  41.3 
 
 
424 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00190835  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0752  hypothetical protein  38.01 
 
 
428 aa  179  4e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000194226 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0945  hypothetical protein  29.19 
 
 
423 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523813  n/a   
 
 
 
NC_007949  Bpro_5161  hypothetical protein  25.47 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0502601  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6926  DNA polymerase beta domain protein region  25.08 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000143596  hitchhiker  0.000343004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1233  hypothetical protein  26.16 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2340  hypothetical protein  23.1 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000406719  unclonable  0.000000155562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1270  hypothetical protein  23.1 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1829  hypothetical protein  23.17 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.660383  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1739  hypothetical protein  28.28 
 
 
358 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3227  hypothetical protein  27.33 
 
 
490 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.999144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7308  hypothetical protein  25 
 
 
288 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000749019  hitchhiker  0.0000983885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>