27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6926 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6926  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 293 aa  595  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000143596  hitchhiker  0.000343004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2340  hypothetical protein  43.48 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000406719  unclonable  0.000000155562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1829  hypothetical protein  45 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.660383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1270  hypothetical protein  44.15 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5161  hypothetical protein  44.22 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0502601  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1739  hypothetical protein  31.11 
 
 		 358 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1233  hypothetical protein  27.7 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0384  hypothetical protein  25.08 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288726 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1515  hypothetical protein  25.4 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.107108  hitchhiker  0.0038288 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0945  hypothetical protein  23.95 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523813  n/a   
 
 
 
NC_011662  Tmz1t_2084  hypothetical protein  26.7 
 
 		 434 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0757382  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2372  hypothetical protein  24.59 
 
 		 321 aa  52.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1036  hypothetical protein  24.57 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4359  hypothetical protein  27.42 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687672  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0355  hypothetical protein  30.51 
 
 		 372 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2233  hypothetical protein  24.32 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000107793  hitchhiker  0.00000113425 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4404  DNA polymerase, beta-like region  26.88 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4493  DNA polymerase, beta-like region  25.67 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521914  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6748  DNA polymerase, beta-like region  25.25 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2331  hypothetical protein  26.47 
 
 		 423 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122664  hitchhiker  0.0000000213226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7308  hypothetical protein  22.73 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000749019  hitchhiker  0.0000983885 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0222  hypothetical protein  25.2 
 
 		 363 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2173  hypothetical protein  30.22 
 
 		 137 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.451741  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1832  hypothetical protein  21.59 
 
 		 442 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539757  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0665  hypothetical protein  21.33 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0752  hypothetical protein  21.58 
 
 		 428 aa  43.9  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000194226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1095  hypothetical protein  27.18 
 
 		 304 aa  42.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>