18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1034 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1034  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  607  1e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0384  hypothetical protein  51.19 
 
 
293 aa  301  7.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.288726 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1515  hypothetical protein  50.51 
 
 
293 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.107108  hitchhiker  0.0038288 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02900  hypothetical protein  48.6 
 
 
296 aa  268  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00646507  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2084  hypothetical protein  41.1 
 
 
434 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0757382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1036  hypothetical protein  32.75 
 
 
294 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2331  hypothetical protein  36.73 
 
 
423 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122664  hitchhiker  0.0000000213226 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_50  hypothetical protein  39.46 
 
 
424 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00190835  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0752  hypothetical protein  37.26 
 
 
428 aa  154  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000194226 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0945  hypothetical protein  28.77 
 
 
423 aa  124  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523813  n/a   
 
 
 
NC_013131  Caci_7308  hypothetical protein  23.51 
 
 
288 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000749019  hitchhiker  0.0000983885 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0665  hypothetical protein  24.24 
 
 
291 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3227  hypothetical protein  22.56 
 
 
490 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.999144  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5161  hypothetical protein  22.51 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0502601  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1233  hypothetical protein  20.67 
 
 
283 aa  49.3  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2340  hypothetical protein  23.22 
 
 
300 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000406719  unclonable  0.000000155562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1270  hypothetical protein  22.73 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2233  hypothetical protein  24.04 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000107793  hitchhiker  0.00000113425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>