20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6748 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6748  DNA polymerase, beta-like region  100 
 
 		 321 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4404  DNA polymerase, beta-like region  77.5 
 
 		 321 aa  526  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4493  DNA polymerase, beta-like region  76.64 
 
 		 321 aa  523  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521914  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2372  hypothetical protein  71.96 
 
 		 321 aa  495  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0126  hypothetical protein  49.22 
 
 		 321 aa  292  5e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4197  hypothetical protein  31.11 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1969  hypothetical protein  28.66 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403251  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5985  DNA polymerase, beta-like region  39.29 
 
 		 163 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4858  hypothetical protein  26.67 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0228529  normal  0.590895 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5161  hypothetical protein  27.23 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0502601  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2233  hypothetical protein  26.88 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000107793  hitchhiker  0.00000113425 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1270  hypothetical protein  24.56 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2340  hypothetical protein  24.56 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000406719  unclonable  0.000000155562 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2331  hypothetical protein  21.38 
 
 		 423 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122664  hitchhiker  0.0000000213226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1832  hypothetical protein  25.71 
 
 		 442 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6926  DNA polymerase beta domain protein region  25.25 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000143596  hitchhiker  0.000343004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1233  hypothetical protein  23.48 
 
 		 283 aa  46.2  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1829  hypothetical protein  25.12 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.660383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1739  hypothetical protein  21.5 
 
 		 358 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3227  hypothetical protein  24.63 
 
 		 490 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.999144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>