11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0126 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0126  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  657    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6748  DNA polymerase, beta-like region  49.22 
 
 		 321 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4404  DNA polymerase, beta-like region  48.11 
 
 		 321 aa  289  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2372  hypothetical protein  47.96 
 
 		 321 aa  288  7e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4493  DNA polymerase, beta-like region  47.34 
 
 		 321 aa  286  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521914  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5985  DNA polymerase, beta-like region  45.4 
 
 		 163 aa  119  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4197  hypothetical protein  25.69 
 
 		 315 aa  92.4  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4858  hypothetical protein  25.52 
 
 		 327 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0228529  normal  0.590895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1969  hypothetical protein  27.03 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403251  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1270  hypothetical protein  21.57 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2340  hypothetical protein  21.57 
 
 		 300 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000406719  unclonable  0.000000155562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>