12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4858 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4858  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  675    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0228529  normal  0.590895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1969  hypothetical protein  32.83 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403251  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4197  hypothetical protein  31.31 
 
 		 315 aa  146  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2372  hypothetical protein  30.09 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4404  DNA polymerase, beta-like region  27.53 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4493  DNA polymerase, beta-like region  28.39 
 
 		 321 aa  99.4  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521914  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6748  DNA polymerase, beta-like region  26.67 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0126  hypothetical protein  25.52 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2053  hypothetical protein  28.23 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  hitchhiker  0.000642876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5985  DNA polymerase, beta-like region  25.93 
 
 		 163 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1739  hypothetical protein  23.02 
 
 		 358 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0355  hypothetical protein  19.89 
 
 		 372 aa  42.4  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>