15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1969 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1969  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  646    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403251  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4197  hypothetical protein  70.57 
 
 		 315 aa  451  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4858  hypothetical protein  32.83 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0228529  normal  0.590895 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4404  DNA polymerase, beta-like region  31.68 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6748  DNA polymerase, beta-like region  29.06 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4493  DNA polymerase, beta-like region  31.15 
 
 		 321 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521914  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2372  hypothetical protein  31.86 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0126  hypothetical protein  27.63 
 
 		 321 aa  85.9  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5985  DNA polymerase, beta-like region  31.1 
 
 		 163 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1739  hypothetical protein  26.55 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2340  hypothetical protein  23.44 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000406719  unclonable  0.000000155562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2822  hypothetical protein  22.76 
 
 		 449 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.816333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1270  hypothetical protein  23.57 
 
 		 300 aa  47.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1829  hypothetical protein  22.92 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.660383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5161  hypothetical protein  23.33 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0502601  normal  0.260377 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>