16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4493 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4493  DNA polymerase, beta-like region  100 
 
 		 321 aa  661    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521914  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4404  DNA polymerase, beta-like region  93.44 
 
 		 321 aa  624  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6748  DNA polymerase, beta-like region  76.64 
 
 		 321 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2372  hypothetical protein  76.56 
 
 		 321 aa  517  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0126  hypothetical protein  47.34 
 
 		 321 aa  286  5e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4197  hypothetical protein  30.56 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1969  hypothetical protein  31.06 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4858  hypothetical protein  28.39 
 
 		 327 aa  99.4  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0228529  normal  0.590895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5985  DNA polymerase, beta-like region  37.74 
 
 		 163 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2233  hypothetical protein  25.46 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000107793  hitchhiker  0.00000113425 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5161  hypothetical protein  27.23 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0502601  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6926  DNA polymerase beta domain protein region  25.67 
 
 		 293 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000143596  hitchhiker  0.000343004 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1739  hypothetical protein  21.97 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1270  hypothetical protein  25 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1832  hypothetical protein  22.86 
 
 		 442 aa  46.2  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539757  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2340  hypothetical protein  25 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000406719  unclonable  0.000000155562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>