96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1330 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1330  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
344 aa  701    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0568  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.26 
 
 
342 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1356  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.75 
 
 
346 aa  326  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.128683  normal  0.36604 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0147  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.9 
 
 
334 aa  268  7e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.9 
 
 
334 aa  268  7e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1280  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.2 
 
 
343 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.73743 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0815  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.77 
 
 
333 aa  253  5.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00070784 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0401  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.54 
 
 
339 aa  238  9e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0867  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.28 
 
 
334 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3586  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.83 
 
 
334 aa  236  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.83 
 
 
334 aa  236  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0027  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.47 
 
 
336 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2659  putative anaerobic sulfite reductase, A subunit  35.93 
 
 
359 aa  229  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0525885  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3430  heterodisulfide reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  36.55 
 
 
342 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0026  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.76 
 
 
336 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0087  heterodisulfide reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  37 
 
 
334 aa  225  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.941895  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1971  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.32 
 
 
350 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17800  4Fe-4S protein  34.81 
 
 
341 aa  216  5.9999999999999996e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1032  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  33.83 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.203704  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0193  iron-sulfur binding protein  34.96 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2312  iron-sulfur binding protein  34.96 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1257  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.45 
 
 
337 aa  212  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0083  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.83 
 
 
339 aa  209  6e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.249908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1212  hydrogenase, putative  34.37 
 
 
359 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1112  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  35.76 
 
 
337 aa  204  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.338031 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2102  hydrogenase, putative  34.68 
 
 
357 aa  203  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0303976  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1253  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  33.72 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0830  hydrogenase, putative  34.59 
 
 
359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379475  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0326  hydrogenase, putative  35.14 
 
 
363 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.384947 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1303  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  32.74 
 
 
337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0853  hydrogenase, putative  33.04 
 
 
342 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.92 
 
 
337 aa  196  6e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0881  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.27 
 
 
349 aa  186  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2664  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.07 
 
 
391 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3529  hydrogenase, putative  35.74 
 
 
362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1125  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.02 
 
 
327 aa  176  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0503  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.96 
 
 
386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213945  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2602  Ni/Fe hydrogenase beta subunit  33.24 
 
 
345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0912  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.44 
 
 
329 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.974369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4823  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.7 
 
 
357 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2586  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.69 
 
 
379 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1861  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  32.97 
 
 
356 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.292424  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1015  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.86 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582823 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1134  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.94 
 
 
375 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0260075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2789  putative anaerobic sulfite reductase, A subunit  32.11 
 
 
360 aa  163  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2798  putative anaerobic sulfite reductase, A subunit  32.11 
 
 
360 aa  163  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04360  Soluble hydrogenase, alpha or beta chain  30.77 
 
 
382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1971  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  33.92 
 
 
325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2496  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  28.69 
 
 
359 aa  161  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2535  hypothetical protein  28.61 
 
 
379 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1260  hypothetical protein  32.69 
 
 
373 aa  159  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.62411  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2129  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  28.81 
 
 
359 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.33959  hitchhiker  0.00742423 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2094  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  29.83 
 
 
359 aa  157  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2166  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  28.12 
 
 
359 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2390  hypothetical protein  27.58 
 
 
379 aa  155  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.43 
 
 
340 aa  155  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0381801  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2246  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.04 
 
 
325 aa  155  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4500  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.85 
 
 
395 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3419  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  32.47 
 
 
352 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3430  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.47 
 
 
352 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.259101  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3482  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.47 
 
 
352 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0532647 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1566  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  27.48 
 
 
359 aa  151  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3471  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  33.33 
 
 
370 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.495148 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1926  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  27.2 
 
 
359 aa  149  9e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0940  [NiFe] hydrogenase, beta subunit, putative  32.52 
 
 
368 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1058  hypothetical protein  32.52 
 
 
368 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637836  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1427  sulfite reductase, iron-sulfur subunit  27.79 
 
 
338 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.131604  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1693  sulfite reductase, iron-sulfur subunit  27.79 
 
 
338 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.060829  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1601  sulfite reductase, subunit A  28.37 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.78 
 
 
349 aa  122  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1789  anaerobic sulfite reductase, A subunit  26.06 
 
 
343 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0801796  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2748  sulfite reductase subunit A  29.44 
 
 
347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2923  sulfite reductase, subunit A  29.17 
 
 
347 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2703  sulfite reductase, subunit A  29.17 
 
 
347 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.15911  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0555  sulfite reductase, subunit A  25.86 
 
 
341 aa  113  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2810  sulfite reductase subunit A  29.17 
 
 
347 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2789  sulfite reductase subunit A  28.89 
 
 
347 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427719  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0419  Formate dehydrogenase  23.29 
 
 
382 aa  50.8  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0607  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  24.61 
 
 
387 aa  48.5  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0368  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 
1193 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1410  4Fe-4S ferredoxin  30 
 
 
960 aa  47.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0567  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.46 
 
 
328 aa  47  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1763  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  27.5 
 
 
923 aa  46.2  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.575647  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2346  Formate dehydrogenase  21.31 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3343  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.97 
 
 
934 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.641395 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0542  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  23.5 
 
 
387 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.428653  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  24.88 
 
 
711 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0162  cytochrome c oxidase accessory protein CcoG  31.52 
 
 
466 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.556528 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1377  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  23.5 
 
 
387 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00118672  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.03 
 
 
277 aa  43.9  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.94097  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0296  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  21.98 
 
 
387 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.510341  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  28.97 
 
 
1032 aa  43.1  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2996  iron-sulfur cluster-binding protein  30.43 
 
 
468 aa  42.7  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.6672  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4603  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  20.56 
 
 
936 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52713  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4738  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  20.56 
 
 
936 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1034  NifJ-like oxidoreductase, Fe-S subunit  25.17 
 
 
1180 aa  42.7  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>