81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1058 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0940  [NiFe] hydrogenase, beta subunit, putative  100 
 
 		 368 aa  753    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1058  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  753    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637836  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2390  hypothetical protein  52.73 
 
 		 379 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2535  hypothetical protein  52.76 
 
 		 379 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1260  hypothetical protein  57.18 
 
 		 373 aa  422  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.62411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2586  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  50.41 
 
 		 379 aa  354  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0503  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  48.33 
 
 		 386 aa  334  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2664  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.13 
 
 		 391 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04360  Soluble hydrogenase, alpha or beta chain  47.81 
 
 		 382 aa  322  9.000000000000001e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1015  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.77 
 
 		 389 aa  317  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1861  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  46.02 
 
 		 356 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.292424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1134  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  48.03 
 
 		 375 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0260075  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3471  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  46.32 
 
 		 370 aa  301  9e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.495148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3419  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  45.69 
 
 		 352 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3430  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.69 
 
 		 352 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.259101  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3482  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.69 
 
 		 352 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0532647 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4500  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.36 
 
 		 395 aa  290  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4823  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  42.41 
 
 		 357 aa  275  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1280  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.26 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.73743 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0147  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.11 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.11 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17800  4Fe-4S protein  33.67 
 
 		 341 aa  160  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1356  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.2 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.128683  normal  0.36604 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0401  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.61 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0912  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.11 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.974369  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1330  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.22 
 
 		 344 aa  149  9e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2102  hydrogenase, putative  32.43 
 
 		 357 aa  146  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0303976  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0568  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.15 
 
 		 342 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1253  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  29.26 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0083  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.67 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.249908  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1971  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.89 
 
 		 350 aa  139  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0815  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.39 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00070784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1971  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  33.94 
 
 		 325 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0881  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.14 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1125  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.97 
 
 		 327 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0087  heterodisulfide reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  30.11 
 
 		 334 aa  132  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.941895  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2246  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.49 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0830  hydrogenase, putative  29.73 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0867  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.03 
 
 		 334 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2602  Ni/Fe hydrogenase beta subunit  32.5 
 
 		 345 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0027  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.99 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0026  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.9 
 
 		 336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0326  hydrogenase, putative  31.42 
 
 		 363 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.384947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3586  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.73 
 
 		 334 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.73 
 
 		 334 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0853  hydrogenase, putative  31.37 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0193  iron-sulfur binding protein  30.47 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2312  iron-sulfur binding protein  30.47 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3430  heterodisulfide reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  26.87 
 
 		 342 aa  119  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1212  hydrogenase, putative  28.81 
 
 		 359 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2789  putative anaerobic sulfite reductase, A subunit  30.08 
 
 		 360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2798  putative anaerobic sulfite reductase, A subunit  30.08 
 
 		 360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2129  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  29.37 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.33959  hitchhiker  0.00742423 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2094  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  27.02 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3529  hydrogenase, putative  31.94 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2659  putative anaerobic sulfite reductase, A subunit  27.42 
 
 		 359 aa  113  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0525885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1032  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  28.47 
 
 		 337 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.203704  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1566  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  27.42 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2496  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  25.16 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1926  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  27.38 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2166  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  25.4 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1693  sulfite reductase, iron-sulfur subunit  25.26 
 
 		 338 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.060829  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1112  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  27.24 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.338031 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.89 
 
 		 340 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0381801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1257  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.09 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.74 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1427  sulfite reductase, iron-sulfur subunit  24.57 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.131604  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1601  sulfite reductase, subunit A  25.93 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1303  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  25.08 
 
 		 337 aa  98.6  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1789  anaerobic sulfite reductase, A subunit  25.38 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0801796  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2748  sulfite reductase subunit A  29.88 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2789  sulfite reductase subunit A  29.88 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0555  sulfite reductase, subunit A  24.28 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2923  sulfite reductase, subunit A  29.88 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2703  sulfite reductase, subunit A  29.88 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.15911  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2810  sulfite reductase subunit A  29.88 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.27 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2346  Formate dehydrogenase  25.57 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0822  formate dehydrogenase  23.08 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1537  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  31.52 
 
 		 375 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0761099  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0813  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  31.52 
 
 		 375 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>