83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4823 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4823  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  100 
 
 
357 aa  724    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1861  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  69.69 
 
 
356 aa  508  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.292424  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0503  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  55.49 
 
 
386 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213945  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04360  Soluble hydrogenase, alpha or beta chain  57.7 
 
 
382 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1015  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  54.6 
 
 
389 aa  392  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582823 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2586  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  54.34 
 
 
379 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2664  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  52.23 
 
 
391 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4500  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  53.78 
 
 
395 aa  362  6e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1134  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  51.65 
 
 
375 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0260075  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3430  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.03 
 
 
352 aa  353  4e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.259101  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3482  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.03 
 
 
352 aa  353  4e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0532647 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3419  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  52.03 
 
 
352 aa  353  4e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3471  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  51.41 
 
 
370 aa  333  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.495148 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2535  hypothetical protein  41.5 
 
 
379 aa  302  5.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2390  hypothetical protein  41.23 
 
 
379 aa  299  4e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1260  hypothetical protein  43.43 
 
 
373 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.62411  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1058  hypothetical protein  42.41 
 
 
368 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637836  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0940  [NiFe] hydrogenase, beta subunit, putative  42.41 
 
 
368 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1280  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.68 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.73743 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1330  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.7 
 
 
344 aa  182  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1253  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  34.11 
 
 
345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.09 
 
 
334 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0147  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.09 
 
 
334 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0401  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.74 
 
 
339 aa  162  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1356  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.4 
 
 
346 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.128683  normal  0.36604 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1257  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.21 
 
 
337 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1125  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.92 
 
 
327 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1303  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  28.25 
 
 
337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0568  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.48 
 
 
342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0815  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.52 
 
 
333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00070784 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1032  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  28.37 
 
 
337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.203704  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0830  hydrogenase, putative  35.25 
 
 
359 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379475  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1112  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  30 
 
 
337 aa  151  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.338031 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2496  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  29.97 
 
 
359 aa  149  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1971  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.47 
 
 
350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1971  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  31.1 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2602  Ni/Fe hydrogenase beta subunit  32.67 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17800  4Fe-4S protein  29.11 
 
 
341 aa  146  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0083  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.86 
 
 
339 aa  145  9e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.249908  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.49 
 
 
337 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0912  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.76 
 
 
329 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.974369  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2129  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  27.95 
 
 
359 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.33959  hitchhiker  0.00742423 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1566  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  28.66 
 
 
359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2094  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  28.96 
 
 
359 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0867  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.41 
 
 
334 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2102  hydrogenase, putative  31.89 
 
 
357 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0303976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0027  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.69 
 
 
336 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0881  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.89 
 
 
349 aa  139  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0326  hydrogenase, putative  33.46 
 
 
363 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.384947 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2246  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.25 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0026  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.55 
 
 
336 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3586  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.07 
 
 
334 aa  136  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.07 
 
 
334 aa  136  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0193  iron-sulfur binding protein  28.61 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2312  iron-sulfur binding protein  28.61 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3430  heterodisulfide reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  33.86 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1926  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  27.04 
 
 
359 aa  132  7.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0087  heterodisulfide reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  30.59 
 
 
334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.941895  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1693  sulfite reductase, iron-sulfur subunit  30.1 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.060829  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1427  sulfite reductase, iron-sulfur subunit  30.1 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.131604  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3529  hydrogenase, putative  32.79 
 
 
362 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2798  putative anaerobic sulfite reductase, A subunit  28.89 
 
 
360 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2789  putative anaerobic sulfite reductase, A subunit  28.89 
 
 
360 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2659  putative anaerobic sulfite reductase, A subunit  29.76 
 
 
359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0525885  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2166  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  26.26 
 
 
359 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1212  hydrogenase, putative  30.65 
 
 
359 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0853  hydrogenase, putative  30.45 
 
 
342 aa  122  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.33 
 
 
340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0381801  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1601  sulfite reductase, subunit A  31.01 
 
 
337 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1789  anaerobic sulfite reductase, A subunit  26.69 
 
 
343 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0801796  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0555  sulfite reductase, subunit A  29.19 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.94 
 
 
349 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2748  sulfite reductase subunit A  29.38 
 
 
347 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2810  sulfite reductase subunit A  30.58 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2789  sulfite reductase subunit A  28.05 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427719  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2703  sulfite reductase, subunit A  28.05 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.15911  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2923  sulfite reductase, subunit A  28.05 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2346  Formate dehydrogenase  23.93 
 
 
380 aa  52.8  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1330  formate dehydrogenase  26.23 
 
 
370 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.342648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0822  formate dehydrogenase  23.26 
 
 
379 aa  46.2  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1537  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  25.25 
 
 
375 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0761099  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0419  Formate dehydrogenase  29.36 
 
 
382 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0813  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  22.45 
 
 
375 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>