78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1601 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1601  sulfite reductase, subunit A  100 
 
 
337 aa  699    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1427  sulfite reductase, iron-sulfur subunit  51.2 
 
 
338 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.131604  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1693  sulfite reductase, iron-sulfur subunit  51.2 
 
 
338 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.060829  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  49.85 
 
 
340 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0381801  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0555  sulfite reductase, subunit A  52.8 
 
 
341 aa  368  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.21 
 
 
349 aa  347  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1789  anaerobic sulfite reductase, A subunit  43.53 
 
 
343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0801796  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2923  sulfite reductase, subunit A  44.05 
 
 
347 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2703  sulfite reductase, subunit A  44.05 
 
 
347 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.15911  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2789  sulfite reductase subunit A  43.75 
 
 
347 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427719  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2810  sulfite reductase subunit A  43.75 
 
 
347 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2748  sulfite reductase subunit A  43.75 
 
 
347 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17800  4Fe-4S protein  28.96 
 
 
341 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0815  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.33 
 
 
333 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00070784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1356  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.68 
 
 
346 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.128683  normal  0.36604 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2659  putative anaerobic sulfite reductase, A subunit  27.14 
 
 
359 aa  143  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0525885  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1330  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.37 
 
 
344 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0401  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.84 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1566  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  28.07 
 
 
359 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1125  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.69 
 
 
327 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0881  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.62 
 
 
349 aa  129  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2094  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  27.49 
 
 
359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0867  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.78 
 
 
334 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0083  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.91 
 
 
339 aa  126  5e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.249908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3430  heterodisulfide reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  25.83 
 
 
342 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2129  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  26.39 
 
 
359 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.33959  hitchhiker  0.00742423 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3586  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.54 
 
 
334 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.54 
 
 
334 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2496  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  26.69 
 
 
359 aa  124  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0147  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.07 
 
 
334 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.07 
 
 
334 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1926  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  25 
 
 
359 aa  122  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2586  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25.71 
 
 
379 aa  122  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0568  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.65 
 
 
342 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1971  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  24.75 
 
 
325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0087  heterodisulfide reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  27.16 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.941895  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2166  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  26.1 
 
 
359 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0912  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.35 
 
 
329 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.974369  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1280  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.78 
 
 
343 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.73743 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2798  putative anaerobic sulfite reductase, A subunit  25 
 
 
360 aa  116  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2789  putative anaerobic sulfite reductase, A subunit  25 
 
 
360 aa  116  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0326  hydrogenase, putative  24.59 
 
 
363 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.384947 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0026  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.32 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0027  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.73 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1253  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  27.57 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2602  Ni/Fe hydrogenase beta subunit  25.3 
 
 
345 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2246  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.47 
 
 
325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1971  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.51 
 
 
350 aa  113  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2102  hydrogenase, putative  26.71 
 
 
357 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0303976  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0830  hydrogenase, putative  25.07 
 
 
359 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379475  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1112  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  27.33 
 
 
337 aa  112  9e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.338031 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.12 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1861  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.18 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.292424  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4823  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.97 
 
 
357 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2664  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.82 
 
 
391 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1257  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.83 
 
 
337 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0503  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.12 
 
 
386 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213945  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1032  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  26.57 
 
 
337 aa  103  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.203704  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1303  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  26.83 
 
 
337 aa  103  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4500  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.15 
 
 
395 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04360  Soluble hydrogenase, alpha or beta chain  27.89 
 
 
382 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1134  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26 
 
 
375 aa  99.8  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0260075  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2535  hypothetical protein  27.08 
 
 
379 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3529  hydrogenase, putative  22.86 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0193  iron-sulfur binding protein  22.38 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2312  iron-sulfur binding protein  22.38 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3482  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.42 
 
 
352 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0532647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3430  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.42 
 
 
352 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.259101  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3419  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27.42 
 
 
352 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2390  hypothetical protein  26.71 
 
 
379 aa  97.1  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1260  hypothetical protein  27.02 
 
 
373 aa  95.1  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.62411  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0940  [NiFe] hydrogenase, beta subunit, putative  25.93 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1058  hypothetical protein  25.93 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637836  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1015  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.59 
 
 
389 aa  95.1  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582823 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0853  hydrogenase, putative  23.36 
 
 
342 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1212  hydrogenase, putative  22.99 
 
 
359 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3471  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  24.8 
 
 
370 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.495148 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2660  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.32 
 
 
339 aa  46.6  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.403976  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>