82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0146 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 334 aa  688    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3586  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 334 aa  688    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3430  heterodisulfide reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  73.65 
 
 		 342 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0087  heterodisulfide reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  72.75 
 
 		 334 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.941895  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0027  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  67.66 
 
 		 336 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0026  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  67.07 
 
 		 336 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0867  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  65.27 
 
 		 334 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1112  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  41.89 
 
 		 337 aa  285  9e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.338031 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1303  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  40.77 
 
 		 337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1257  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.48 
 
 		 337 aa  279  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1032  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  40.95 
 
 		 337 aa  278  7e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.203704  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.46 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0147  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.67 
 
 		 334 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.67 
 
 		 334 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1280  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.39 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.73743 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0815  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.17 
 
 		 333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00070784 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0568  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1330  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.83 
 
 		 344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1356  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.46 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.128683  normal  0.36604 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1212  hydrogenase, putative  38.35 
 
 		 359 aa  226  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0401  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.53 
 
 		 339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0193  iron-sulfur binding protein  37.79 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2312  iron-sulfur binding protein  37.79 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2102  hydrogenase, putative  35.85 
 
 		 357 aa  205  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0303976  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0830  hydrogenase, putative  36.72 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1971  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.39 
 
 		 350 aa  203  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0326  hydrogenase, putative  36.47 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.384947 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0853  hydrogenase, putative  36.09 
 
 		 342 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2659  putative anaerobic sulfite reductase, A subunit  34.26 
 
 		 359 aa  189  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0525885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17800  4Fe-4S protein  33.57 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3529  hydrogenase, putative  36.68 
 
 		 362 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0083  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.62 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.249908  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0503  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.81 
 
 		 386 aa  149  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1253  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  31.11 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2390  hypothetical protein  28.53 
 
 		 379 aa  146  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1125  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.37 
 
 		 327 aa  146  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0912  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.99 
 
 		 329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.974369  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2664  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.96 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.97 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0381801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0881  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.65 
 
 		 349 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2535  hypothetical protein  28.89 
 
 		 379 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04360  Soluble hydrogenase, alpha or beta chain  29.58 
 
 		 382 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2586  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.26 
 
 		 379 aa  142  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1971  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  31.94 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1693  sulfite reductase, iron-sulfur subunit  26.93 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.060829  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1427  sulfite reductase, iron-sulfur subunit  27.56 
 
 		 338 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.131604  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2789  putative anaerobic sulfite reductase, A subunit  29.38 
 
 		 360 aa  139  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2798  putative anaerobic sulfite reductase, A subunit  29.38 
 
 		 360 aa  139  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2602  Ni/Fe hydrogenase beta subunit  29.13 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2166  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  28.29 
 
 		 359 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2246  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.88 
 
 		 325 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1015  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.66 
 
 		 389 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582823 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1926  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  27.62 
 
 		 359 aa  133  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3471  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.06 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.495148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4823  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  32.68 
 
 		 357 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2129  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  28.78 
 
 		 359 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.33959  hitchhiker  0.00742423 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2094  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  28.37 
 
 		 359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1260  hypothetical protein  32.1 
 
 		 373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.62411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1134  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.79 
 
 		 375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0260075  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1861  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.02 
 
 		 356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.292424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3419  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.32 
 
 		 352 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3482  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.32 
 
 		 352 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0532647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3430  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.32 
 
 		 352 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.259101  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1601  sulfite reductase, subunit A  27.54 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0555  sulfite reductase, subunit A  26.5 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1566  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  27.67 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1058  hypothetical protein  27.73 
 
 		 368 aa  119  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0940  [NiFe] hydrogenase, beta subunit, putative  27.73 
 
 		 368 aa  119  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2496  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  25.29 
 
 		 359 aa  119  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1789  anaerobic sulfite reductase, A subunit  24.57 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0801796  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2748  sulfite reductase subunit A  24.5 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2810  sulfite reductase subunit A  24.78 
 
 		 347 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2703  sulfite reductase, subunit A  24.5 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.15911  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2923  sulfite reductase, subunit A  24.5 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2789  sulfite reductase subunit A  24.21 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.84 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2101  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  28.83 
 
 		 482 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.212274  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1304  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.49 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1031  hydrogenase, iron-sulfur binding protein, putative  24.03 
 
 		 278 aa  43.9  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0567  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.21 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.01 
 
 		 438 aa  42.7  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.742352  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2146  hypothetical protein  55.56 
 
 		 441 aa  42.7  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>