More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4569 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4569  aspartate carbamoyltransferase  100 
 
 
303 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.300377 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  52.33 
 
 
313 aa  285  5e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  48.18 
 
 
311 aa  282  6.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  51.18 
 
 
313 aa  282  6.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  49.34 
 
 
309 aa  278  6e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.17 
 
 
311 aa  278  7e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.5 
 
 
315 aa  276  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  50.83 
 
 
306 aa  276  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.17 
 
 
310 aa  276  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  50.5 
 
 
305 aa  276  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.85 
 
 
312 aa  275  6e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3190  aspartate carbamoyltransferase  49.83 
 
 
319 aa  275  6e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482997  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.19 
 
 
317 aa  275  7e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.5 
 
 
316 aa  275  8e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2268  aspartate carbamoyltransferase  49.66 
 
 
315 aa  274  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.33 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.17 
 
 
311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.16 
 
 
334 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47 
 
 
311 aa  273  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0733  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49 
 
 
311 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0612  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.83 
 
 
313 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.295857  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.5 
 
 
316 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.83 
 
 
310 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.83 
 
 
315 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
308 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.83 
 
 
315 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  49.67 
 
 
312 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.83 
 
 
311 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.83 
 
 
319 aa  269  4e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.04 
 
 
313 aa  269  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.17 
 
 
304 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.175577  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  50.17 
 
 
312 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49 
 
 
313 aa  268  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.85 
 
 
317 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.16 
 
 
310 aa  267  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1641  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.16 
 
 
321 aa  267  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.452041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.34 
 
 
315 aa  266  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.96 
 
 
323 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1199  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.51 
 
 
331 aa  265  7e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000831641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.48 
 
 
309 aa  264  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  48.86 
 
 
316 aa  263  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  48.67 
 
 
302 aa  263  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4725  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.84 
 
 
317 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0503  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.34 
 
 
312 aa  263  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0338301  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3848  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.51 
 
 
316 aa  263  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0236185 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_982  aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain  46.56 
 
 
331 aa  263  3e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1009  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.51 
 
 
331 aa  263  3e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3091  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
316 aa  263  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559987  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.49 
 
 
310 aa  262  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.34 
 
 
308 aa  262  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2521  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.62 
 
 
343 aa  262  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.191298 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2893  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.71 
 
 
320 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2324  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.95 
 
 
346 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0736648 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.71 
 
 
320 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.503342 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  49.18 
 
 
329 aa  261  6.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1465  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.95 
 
 
343 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981882  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0385  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.37 
 
 
343 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0867  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.37 
 
 
343 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1994  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.7 
 
 
343 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165088  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  53.79 
 
 
311 aa  260  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.29 
 
 
328 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3167  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.7 
 
 
343 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48 
 
 
318 aa  260  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.03 
 
 
308 aa  260  2e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0838  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.37 
 
 
343 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.677096  hitchhiker  0.0028837 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.7 
 
 
361 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2749  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.7 
 
 
361 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3145  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.7 
 
 
361 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3109  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.7 
 
 
361 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2007  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.19 
 
 
362 aa  259  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3965  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.37 
 
 
381 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.603902 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.7 
 
 
361 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0541  aspartate carbamoyltransferase  45.15 
 
 
306 aa  259  4e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000499557  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2247  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.85 
 
 
317 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.414785 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0599  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.67 
 
 
322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0564  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.67 
 
 
322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15550  aspartate carbamoyltransferase  48.2 
 
 
310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.65 
 
 
323 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3028  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.85 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285295  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.65 
 
 
323 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.73 
 
 
323 aa  258  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.67 
 
 
322 aa  259  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0757  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.04 
 
 
343 aa  258  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305012 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.04 
 
 
343 aa  258  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.03 
 
 
323 aa  258  8e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.816603  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.33 
 
 
313 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4614  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.04 
 
 
320 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.33 
 
 
313 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3890  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.4 
 
 
319 aa  257  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.04 
 
 
341 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.33 
 
 
323 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.3 
 
 
315 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3527  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.52 
 
 
317 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2424  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.85 
 
 
317 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0394509 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3061  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.02 
 
 
341 aa  257  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.280506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.7 
 
 
312 aa  256  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3070  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.34 
 
 
319 aa  257  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.87496  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0839  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.33 
 
 
321 aa  256  3e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.111278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.15 
 
 
316 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1391  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49 
 
 
318 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621598  normal  0.105088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>