More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0455 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0455  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  100 
 
 
303 aa  612  9.999999999999999e-175  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1496  Deoxyribonuclease V  41.95 
 
 
209 aa  134  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0350  deoxyribonuclease V  38.74 
 
 
225 aa  126  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.34523  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0682  deoxyribonuclease V  37.62 
 
 
232 aa  126  5e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.718465  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0038  Deoxyribonuclease V  39.13 
 
 
226 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0602  endonuclease V (deoxyinosine 3'endoduclease)  37.78 
 
 
232 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  7.42515e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2758  deoxyribonuclease V  34.86 
 
 
222 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0932  deoxyribonuclease V  34.42 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000151025  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4060  Deoxyribonuclease V  36.63 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.145804 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0771  endonuclease V  37.5 
 
 
228 aa  119  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.784275  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1562  deoxyribonuclease V  37.97 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0101  Deoxyribonuclease V  34.86 
 
 
226 aa  115  8.999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000658544  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0954  deoxyribonuclease V  34.15 
 
 
225 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000171059  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0871  Deoxyribonuclease V  38.3 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3087  Deoxyribonuclease V  36.63 
 
 
239 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674348  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0299  endonuclease V  37.32 
 
 
229 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1279  deoxyribonuclease V  38.67 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0152491  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0299  endonuclease V  37.32 
 
 
229 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2382  deoxyribonuclease V  33.18 
 
 
222 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1244  deoxyribonuclease V  37.32 
 
 
228 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0616034  hitchhiker  0.00561497 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0211  endonuclease V  34.62 
 
 
223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.410173  normal  0.0295932 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2425  endonuclease V  36.7 
 
 
229 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1932  deoxyribonuclease V  36.45 
 
 
234 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2338  endonuclease V  39.09 
 
 
214 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0237302 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13030  endonuclease V  37.07 
 
 
221 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4575  endonuclease V  33.17 
 
 
223 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.553382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4412  endonuclease V  33.17 
 
 
223 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.209613  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4501  endonuclease V  33.17 
 
 
223 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4379  endonuclease V  33.17 
 
 
223 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.872195 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4499  endonuclease V  33.17 
 
 
223 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.105241 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4541  endonuclease V  34.12 
 
 
223 aa  106  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.905836  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4232  endonuclease V  34.12 
 
 
223 aa  106  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4489  endonuclease V  34.12 
 
 
223 aa  106  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.730874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03875  endonuclease V  34.12 
 
 
223 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3996  Deoxyribonuclease V  34.12 
 
 
223 aa  105  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5467  endonuclease V  34.12 
 
 
223 aa  105  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581588  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4446  endonuclease V  34.12 
 
 
223 aa  105  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000793274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6470  Deoxyribonuclease V  37.44 
 
 
230 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0671268  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03828  hypothetical protein  34.12 
 
 
223 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4027  endonuclease V  34.12 
 
 
223 aa  105  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0184754 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0899  endonuclease V  32.3 
 
 
237 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0261  deoxyribonuclease V  33.49 
 
 
234 aa  105  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413512  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0686  endonuclease V  36.55 
 
 
221 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.474845 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0353  Deoxyribonuclease V  33.17 
 
 
221 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3345  deoxyribonuclease V  34.76 
 
 
242 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00000497399  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2108  endonuclease V  38.5 
 
 
217 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3033  Deoxyribonuclease V  34.82 
 
 
234 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.329103  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3712  endonuclease V  33.01 
 
 
224 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0220  endonuclease V  34.29 
 
 
229 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1073  endonuclease V  30.52 
 
 
243 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.646298  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0819  endonuclease V  36.73 
 
 
221 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000867821  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2984  Deoxyribonuclease V  34.36 
 
 
250 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0954  endonuclease V  30.52 
 
 
262 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.406571  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3125  endonuclease V  34.41 
 
 
260 aa  102  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0288  endonuclease V  32.69 
 
 
228 aa  102  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.247957  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0224  endonuclease V  33.33 
 
 
229 aa  102  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3046  Deoxyribonuclease V  33.66 
 
 
223 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000285667 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0388  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  47.47 
 
 
99 aa  101  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.695681 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2526  endonuclease V  33.99 
 
 
227 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.60991 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2187  deoxyribonuclease V  34.05 
 
 
226 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3866  endonuclease V  31.73 
 
 
224 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33580  Endonuclease V  37.06 
 
 
234 aa  99.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal  0.688639 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0258  deoxyribonuclease V  37.2 
 
 
230 aa  99.8  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109742  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0569  endonuclease V  33.98 
 
 
221 aa  99  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000150735  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1173  deoxyribonuclease V  35.38 
 
 
221 aa  98.2  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6148  Deoxyribonuclease V  32.51 
 
 
230 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.184211  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3063  deoxyinosine 3'endonuclease (endonuclease V)  33.19 
 
 
235 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00139902  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1366  endonuclease V  35.12 
 
 
200 aa  97.1  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0543  endonuclease V  36.22 
 
 
223 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265335  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_508  nfi endonuclease V  34.78 
 
 
223 aa  97.1  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000219342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3689  endonuclease V  35.1 
 
 
228 aa  97.1  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46839  normal  0.0492677 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0045  endonuclease V  32.88 
 
 
222 aa  95.9  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4912  endonuclease V  38.65 
 
 
227 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.710314 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3591  deoxyribonuclease V  34.83 
 
 
219 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.515588  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5432  deoxyribonuclease V  36.68 
 
 
225 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661836  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1668  deoxyribonuclease V  29.77 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.354519  normal  0.261069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0246  Deoxyribonuclease V  34.17 
 
 
220 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.520455 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0352  endonuclease V  30.17 
 
 
246 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209989  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0460  endonuclease V  30.17 
 
 
246 aa  94  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739903 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0598  Endonuclease V  30.63 
 
 
297 aa  93.2  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2631  Deoxyribonuclease V  35.44 
 
 
265 aa  92.8  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1980  deoxyribonuclease V  34.67 
 
 
231 aa  92.8  6e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.102855  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3848  endonuclease V  29.95 
 
 
234 aa  92.8  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1068  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  48.91 
 
 
99 aa  92.4  7e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2200  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  54.02 
 
 
107 aa  91.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000451364  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2231  Deoxyribonuclease V  36.93 
 
 
223 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0289774  hitchhiker  0.00000293854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2472  deoxyribonuclease V  32.67 
 
 
220 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.330329  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2452  Deoxyribonuclease V  34.47 
 
 
269 aa  91.3  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.725202  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2695  Deoxyribonuclease V  32.67 
 
 
220 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3982  Deoxyribonuclease V  34.93 
 
 
223 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0217  deoxyribonuclease V  33.67 
 
 
219 aa  90.5  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.438952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2924  deoxyribonuclease V  34.69 
 
 
232 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2395  deoxyribonuclease V  32.42 
 
 
221 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2966  Deoxyribonuclease V  35.51 
 
 
272 aa  89.7  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178945  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3179  endonuclease V  32.51 
 
 
240 aa  89.7  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0625  Deoxyribonuclease V  35.06 
 
 
218 aa  89.7  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0879  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  46.74 
 
 
99 aa  89.7  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0631012  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1197  Deoxyribonuclease V  34.45 
 
 
227 aa  89  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.159778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3899  Deoxyribonuclease V  33.97 
 
 
223 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172074  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1127  Deoxyribonuclease V  34.13 
 
 
282 aa  87.4  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>