108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1980 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1980  deoxyribonuclease V  100 
 
 		 231 aa  462  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.102855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0686  endonuclease V  68.78 
 
 		 221 aa  331  6e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.474845 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2338  endonuclease V  67.3 
 
 		 214 aa  295  5e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0237302 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2108  endonuclease V  65.12 
 
 		 217 aa  293  2e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1244  deoxyribonuclease V  46.04 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0616034  hitchhiker  0.00561497 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0871  Deoxyribonuclease V  38.68 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0932  deoxyribonuclease V  37.85 
 
 		 225 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000151025  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0954  deoxyribonuclease V  38.89 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000171059  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3689  endonuclease V  41.36 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46839  normal  0.0492677 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0350  deoxyribonuclease V  38.28 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.34523  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1562  deoxyribonuclease V  35.58 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0284  Deoxyribonuclease V  43.27 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6148  Deoxyribonuclease V  38.05 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.184211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0101  Deoxyribonuclease V  32.72 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000658544  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1400  endonuclease V  43.54 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2231  Deoxyribonuclease V  39.44 
 
 		 223 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0289774  hitchhiker  0.00000293854 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1279  deoxyribonuclease V  39.81 
 
 		 223 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0152491  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1173  deoxyribonuclease V  34.98 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0299  endonuclease V  37.89 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6470  Deoxyribonuclease V  35.71 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0671268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0299  endonuclease V  37.89 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0625  Deoxyribonuclease V  42.44 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2758  deoxyribonuclease V  42.25 
 
 		 222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0682  deoxyribonuclease V  38.81 
 
 		 232 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.718465  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2187  deoxyribonuclease V  41.51 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0771  endonuclease V  32.34 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.784275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0602  endonuclease V (deoxyinosine 3'endoduclease)  41.59 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  7.42515e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3125  endonuclease V  33.98 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2382  deoxyribonuclease V  41.18 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4157  deoxyribonuclease V  44.72 
 
 		 189 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0737618  decreased coverage  0.000116375 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0257  Deoxyribonuclease V  36.63 
 
 		 198 aa  111  8.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0543  endonuclease V  37.24 
 
 		 223 aa  111  9e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265335  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03875  endonuclease V  38.1 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3996  Deoxyribonuclease V  38.1 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0569  endonuclease V  36.73 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000150735  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0211  endonuclease V  36.22 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.410173  normal  0.0295932 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4232  endonuclease V  38.1 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4541  endonuclease V  38.1 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.905836  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4027  endonuclease V  38.1 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0184754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4446  endonuclease V  38.1 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000793274 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4489  endonuclease V  38.1 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.730874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5467  endonuclease V  38.1 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03828  hypothetical protein  38.1 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0819  endonuclease V  40.31 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000867821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0261  deoxyribonuclease V  36.27 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0288  endonuclease V  38.14 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.247957  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13030  endonuclease V  40.44 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0038  Deoxyribonuclease V  38.79 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4501  endonuclease V  37.65 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476101 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4499  endonuclease V  37.65 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.105241 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4379  endonuclease V  37.65 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.872195 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4412  endonuclease V  37.65 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.209613  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4575  endonuclease V  37.65 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.553382 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1932  deoxyribonuclease V  38.05 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3345  deoxyribonuclease V  41.36 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00000497399  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0460  endonuclease V  37.14 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0352  endonuclease V  37.14 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209989  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3866  endonuclease V  36.45 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1668  deoxyribonuclease V  38.02 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.354519  normal  0.261069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3848  endonuclease V  37.43 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_508  nfi endonuclease V  35.71 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000219342  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3777  deoxyribonuclease V  40.99 
 
 		 199 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3712  endonuclease V  37.29 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2400  Deoxyribonuclease V  37.78 
 
 		 220 aa  104  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0714775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1366  endonuclease V  42.01 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1073  endonuclease V  35.03 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.646298  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0954  endonuclease V  35.03 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.406571  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2472  deoxyribonuclease V  38.51 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.330329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2695  Deoxyribonuclease V  38.51 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4912  endonuclease V  35.64 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.710314 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0220  endonuclease V  36.16 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0045  endonuclease V  40 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1151  endonuclease V  42.22 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3356  Deoxyribonuclease V  41.34 
 
 		 228 aa  101  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4060  Deoxyribonuclease V  31.92 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.145804 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0224  endonuclease V  36.16 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2425  endonuclease V  36.71 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0246  Deoxyribonuclease V  38.59 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.520455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0217  deoxyribonuclease V  37.43 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.438952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5432  deoxyribonuclease V  39.49 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661836  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2395  deoxyribonuclease V  39.11 
 
 		 221 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3087  Deoxyribonuclease V  34.3 
 
 		 239 aa  99.4  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33580  Endonuclease V  38.78 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal  0.688639 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3179  endonuclease V  37.44 
 
 		 240 aa  98.6  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1197  Deoxyribonuclease V  39.05 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.159778 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3591  deoxyribonuclease V  35.23 
 
 		 219 aa  98.2  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.515588  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3033  Deoxyribonuclease V  35.94 
 
 		 234 aa  96.7  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.329103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3899  Deoxyribonuclease V  38.62 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172074  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2924  deoxyribonuclease V  38.1 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1457  Deoxyribonuclease V  40.23 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.162733  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0258  deoxyribonuclease V  33.8 
 
 		 230 aa  95.5  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3046  Deoxyribonuclease V  40.74 
 
 		 223 aa  95.9  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000285667 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0899  endonuclease V  36.41 
 
 		 237 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2526  endonuclease V  39.16 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.60991 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2984  Deoxyribonuclease V  41.71 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3063  deoxyinosine 3'endonuclease (endonuclease V)  31.94 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00139902  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0455  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  34.67 
 
 		 303 aa  92.8  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2816  Endonuclease V  38.85 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167125  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04762  endonuclease V  37.06 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324275  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0353  Deoxyribonuclease V  42.31 
 
 		 221 aa  88.6  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>