110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3689 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3689  endonuclease V  100 
 
 		 228 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46839  normal  0.0492677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6470  Deoxyribonuclease V  58.02 
 
 		 230 aa  261  6.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0671268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33580  Endonuclease V  50.68 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal  0.688639 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0217  deoxyribonuclease V  51.67 
 
 		 219 aa  228  8e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.438952  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3179  endonuclease V  50.47 
 
 		 240 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2382  deoxyribonuclease V  46.73 
 
 		 222 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0045  endonuclease V  49.29 
 
 		 222 aa  218  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0299  endonuclease V  50.96 
 
 		 229 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0299  endonuclease V  50.96 
 
 		 229 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3356  Deoxyribonuclease V  53.67 
 
 		 228 aa  214  8e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0246  Deoxyribonuclease V  49.53 
 
 		 220 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.520455 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0819  endonuclease V  46.89 
 
 		 221 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000867821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1668  deoxyribonuclease V  52.29 
 
 		 279 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.354519  normal  0.261069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4912  endonuclease V  48.6 
 
 		 227 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.710314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2758  deoxyribonuclease V  46.92 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0284  Deoxyribonuclease V  45.98 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1932  deoxyribonuclease V  46.86 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2231  Deoxyribonuclease V  47.69 
 
 		 223 aa  205  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0289774  hitchhiker  0.00000293854 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3591  deoxyribonuclease V  47.14 
 
 		 219 aa  204  6e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.515588  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0038  Deoxyribonuclease V  47.91 
 
 		 226 aa  204  7e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2924  deoxyribonuclease V  46.51 
 
 		 232 aa  204  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0569  endonuclease V  46.38 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000150735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2816  Endonuclease V  49.05 
 
 		 221 aa  202  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1457  Deoxyribonuclease V  51.67 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.162733  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_508  nfi endonuclease V  43.96 
 
 		 223 aa  201  8e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000219342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0602  endonuclease V (deoxyinosine 3'endoduclease)  46.73 
 
 		 232 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  7.42515e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3345  deoxyribonuclease V  45.93 
 
 		 242 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00000497399  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2395  deoxyribonuclease V  48.1 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0625  Deoxyribonuclease V  47.71 
 
 		 218 aa  198  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1400  endonuclease V  49.07 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5432  deoxyribonuclease V  48.36 
 
 		 225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661836  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3046  Deoxyribonuclease V  47.47 
 
 		 223 aa  195  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000285667 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0543  endonuclease V  44.44 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265335  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4157  deoxyribonuclease V  49.17 
 
 		 189 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0737618  decreased coverage  0.000116375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3899  Deoxyribonuclease V  51.92 
 
 		 223 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172074  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3777  deoxyribonuclease V  48.35 
 
 		 199 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2472  deoxyribonuclease V  46.19 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.330329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2695  Deoxyribonuclease V  46.19 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6148  Deoxyribonuclease V  41.44 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.184211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2526  endonuclease V  45.45 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.60991 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0258  deoxyribonuclease V  41.7 
 
 		 230 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13030  endonuclease V  44.44 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0460  endonuclease V  46.37 
 
 		 246 aa  179  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0352  endonuclease V  46.37 
 
 		 246 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209989  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0771  endonuclease V  41.21 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.784275  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0211  endonuclease V  43.72 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.410173  normal  0.0295932 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3848  endonuclease V  46.37 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2400  Deoxyribonuclease V  43.81 
 
 		 220 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0714775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2187  deoxyribonuclease V  42.86 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03875  endonuclease V  41.95 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3996  Deoxyribonuclease V  41.95 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4232  endonuclease V  41.95 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4541  endonuclease V  41.95 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.905836  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4027  endonuclease V  41.95 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0184754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4446  endonuclease V  41.95 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000793274 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4489  endonuclease V  41.95 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.730874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5467  endonuclease V  41.95 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03828  hypothetical protein  41.95 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1151  endonuclease V  40.36 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0261  deoxyribonuclease V  42.86 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413512  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4501  endonuclease V  41.21 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476101 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4499  endonuclease V  41.21 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.105241 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4379  endonuclease V  41.21 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.872195 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4412  endonuclease V  41.21 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.209613  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4575  endonuclease V  41.21 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.553382 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0871  Deoxyribonuclease V  40.1 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2425  endonuclease V  43.5 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3866  endonuclease V  41.71 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0954  deoxyribonuclease V  40.55 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000171059  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3712  endonuclease V  42.56 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4060  Deoxyribonuclease V  39.51 
 
 		 232 aa  168  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.145804 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0932  deoxyribonuclease V  39.63 
 
 		 225 aa  168  8e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000151025  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3982  Deoxyribonuclease V  41.2 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0220  endonuclease V  42.21 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0224  endonuclease V  42.21 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1279  deoxyribonuclease V  42.03 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0152491  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3125  endonuclease V  39.34 
 
 		 260 aa  164  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1173  deoxyribonuclease V  38.43 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0288  endonuclease V  39.9 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.247957  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3087  Deoxyribonuclease V  36.77 
 
 		 239 aa  161  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1197  Deoxyribonuclease V  42.4 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.159778 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1073  endonuclease V  37.21 
 
 		 243 aa  157  9e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.646298  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0954  endonuclease V  38.1 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.406571  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04762  endonuclease V  44.16 
 
 		 237 aa  154  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324275  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0101  Deoxyribonuclease V  39.15 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000658544  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0899  endonuclease V  39.46 
 
 		 237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1562  deoxyribonuclease V  36.57 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0682  deoxyribonuclease V  42.78 
 
 		 232 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.718465  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3033  Deoxyribonuclease V  38.57 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.329103  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3063  deoxyinosine 3'endonuclease (endonuclease V)  38.53 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00139902  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0350  deoxyribonuclease V  40.67 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.34523  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1244  deoxyribonuclease V  39.61 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0616034  hitchhiker  0.00561497 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1496  Deoxyribonuclease V  38.12 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0353  Deoxyribonuclease V  39 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2984  Deoxyribonuclease V  41.52 
 
 		 250 aa  131  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2452  Deoxyribonuclease V  36.57 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.725202  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3336  Deoxyribonuclease V  37.96 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2966  Deoxyribonuclease V  39.2 
 
 		 272 aa  125  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1980  deoxyribonuclease V  41.36 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.102855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2631  Deoxyribonuclease V  37 
 
 		 265 aa  120  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>