110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_R0012 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_R0012  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0188639 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0048  tRNA-Ser  95.92 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt09  tRNA-Ser  95.24 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0056  tRNA-Ser  95.24 
 
 		 93 bp  67.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0268608  normal  0.036349 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Pseudo-1  tRNA-OTHER  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.526537  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0014  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 92 bp  60  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03460  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0034  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1941  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0070  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.399314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2014  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0295784  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0010  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0597346  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0036  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688413  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0018  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.648957  normal  0.166576 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0088  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0026  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0062  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0060  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0031  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0145328  normal  0.103161 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0785  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1078  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0381421  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0631  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0533  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2051  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0024  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0062  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0062  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0034  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.355586  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0029  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.467256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna37  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0032  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.597346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0051  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.352709 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00032  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000331013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0043  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0020807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4672  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000507057  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5040  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0066  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  0.681656 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0048  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171886  normal  0.292826 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0011  tRNA-Ser  87.76 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2165  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00542927  normal  0.154256 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2218  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00379666  normal  0.543792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2161  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000713726  normal  0.978327 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2065  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000178932  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0052  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.360325 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0057  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0041  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0043  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86437  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0066  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00163913  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0021  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00559548  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1149  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000101348  hitchhiker  0.0000000000000214207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0969  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000352025  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2818  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000985587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt19  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00413231 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0036  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.5837599999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0003  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 96 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000368524  hitchhiker  0.00000112362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0042  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00852582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0046  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.506638  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0053  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0350418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1265  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0405383  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0048  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.250098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57943  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Pseudo-2  tRNA-OTHER  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.520192  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.510614  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.232156  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0002  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0051    93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0053  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0022  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0055  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.265922  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0015  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0069  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234081 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0034  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184009  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0023  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0059  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00925485  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer01  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0568907  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0007  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0017  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.54444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0002  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00130042  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309197  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.159743  normal  0.113678 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0037  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0056  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607701  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA6  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0052  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4609  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0054  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.35196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0004  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0005  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0203622  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0060  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.943942 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna38  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0004  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0030  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0056  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129701  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0006  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0043  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.106219  normal  0.177899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0006  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0906398  normal  0.0288361 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>