48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_R0043 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1265  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  89.7  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0405383  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  97.78 
 
 		 90 bp  81.8  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2271  tRNA-Ser  97.78 
 
 		 93 bp  81.8  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.199643  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2146  tRNA-Ser  97.78 
 
 		 93 bp  81.8  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.643322  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1587  tRNA-Ser  97.78 
 
 		 93 bp  81.8  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.105956  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0343  tRNA-Ser  97.78 
 
 		 90 bp  81.8  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00912352  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1751  tRNA-Ser  97.78 
 
 		 90 bp  81.8  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.921389  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1331  tRNA-Ser  97.78 
 
 		 91 bp  81.8  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0049  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.694922  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0008  tRNA-Ser  97.3 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000307717  hitchhiker  0.0000000040984 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0141  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0047  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0048  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0798542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0004  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198819  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0011  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 96 bp  50.1  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0060  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0008  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 96 bp  50.1  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000013912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0002  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0053  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4596  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0063  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.6315500000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0046  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0006  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0012  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0188639 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0023  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.137885 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0005  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0203622  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0009  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000326555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0002  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000899468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0053  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0350418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0056  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00413677  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0022  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0006  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.22052e-25 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0046  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.506638  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0056  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607701  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0037  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0002  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00130042  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0007  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000625255  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0048  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0004  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0003  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0135552  hitchhiker  0.000657506 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2302  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0031267  hitchhiker  2.33425e-18 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0004  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000214233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0066  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00163913  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0308  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0021  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00559548  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0053  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.163245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>