68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1751 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0343  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00912352  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1751  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.921389  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1265  tRNA-Ser  98.85 
 
 		 87 bp  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0405383  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2271  tRNA-Ser  96.7 
 
 		 93 bp  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.199643  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2146  tRNA-Ser  94.51 
 
 		 93 bp  133  7.999999999999999e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.643322  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1331  tRNA-Ser  94.51 
 
 		 91 bp  133  7.999999999999999e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1587  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 93 bp  117  5e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.105956  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0043  tRNA-Ser  97.78 
 
 		 90 bp  81.8  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0008  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000307717  hitchhiker  0.0000000040984 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0015  tRNA-Ser  92.59 
 
 		 91 bp  67.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0049  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.694922  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0141  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0002  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 95 bp  58  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0008  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 96 bp  58  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000013912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0011  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 96 bp  58  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0004  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198819  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0060  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0004  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000366814 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0048  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0798542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0047  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0002  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00386906  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0019  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0064  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.59858e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0068  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 96 bp  44.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0993  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000644963  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0027  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2234  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0043  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.569209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0004  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000327404  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0886  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000841076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0040  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.140248 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0004  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0048  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000235294  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0029  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0057  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0039  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0041  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0015  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0656  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0033  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56325  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0657  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.96086  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.179799  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt11  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644598  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt13  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt18  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt13  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt19  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0026  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.548362  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0041  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0015  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4302  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0357702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0057  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.328322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0035  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135088  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0025  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1096  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0020  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000716898  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0067  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0041  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0253572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0058  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.325073  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0308  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0911  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.531015  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0045  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0009  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.509163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1009  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>