34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1265 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1265  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0405383  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0343  tRNA-Ser  98.85 
 
 		 90 bp  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00912352  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  98.85 
 
 		 90 bp  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1751  tRNA-Ser  98.85 
 
 		 90 bp  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.921389  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2146  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 93 bp  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.643322  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2271  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 93 bp  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.199643  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1587  tRNA-Ser  93.18 
 
 		 93 bp  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.105956  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1331  tRNA-Ser  93.18 
 
 		 91 bp  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  89.7  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0008  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  79.8  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000307717  hitchhiker  0.0000000040984 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0015  tRNA-Ser  92.59 
 
 		 91 bp  67.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0141  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0002  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 95 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0008  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 96 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000013912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0011  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 96 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0049  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.694922  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0012  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0188639 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0004  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198819  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0060  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0009  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.509163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0021  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00559548  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0002  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00386906  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0047  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0048  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0798542  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0066  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00163913  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0029  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0039  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0004  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000214233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0064  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.59858e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4302  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0357702  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0048  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0004  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000366814 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0003  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0135552  hitchhiker  0.000657506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>