21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_R0049 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_R0049  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.694922  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0043  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0021  tRNA-Ser  86.49 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00559548  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0003  tRNA-Ser  85.53 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0135552  hitchhiker  0.000657506 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0004  tRNA-Ser  85.53 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000214233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2271  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 93 bp  60  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.199643  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1331  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1751  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.921389  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0343  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00912352  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1265  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0405383  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0008  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000307717  hitchhiker  0.0000000040984 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0066  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00163913  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0023  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290353  normal  0.259608 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1587  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.105956  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2146  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.643322  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0047  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0063  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.6315500000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0048  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0798542  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0003  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>