10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PGt09 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PGt09  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177778 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0010  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 93 bp  73.8  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0597346  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0018  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 93 bp  73.8  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.648957  normal  0.166576 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0012  tRNA-Ser  95.24 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0188639 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0032  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891342 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0023  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290353  normal  0.259608 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0056  tRNA-Ser  91.3 
 
 		 93 bp  60  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0268608  normal  0.036349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0048  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0014  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0003  tRNA-Ser  84.85 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>