36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_R0034 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_R0034  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184009  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0014  tRNA-Ser  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0061  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.632048 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0037  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.517191  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0043  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000207344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0061  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.488767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0048  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0533  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.597346 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2051  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0024  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0062  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0062  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0034  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.355586  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0029  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.467256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna37  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0032  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0631  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985518  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1078  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0381421  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0785  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0060  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0062  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer01  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0568907  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0088  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0036  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688413  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2014  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0295784  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0070  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.399314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1941  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0034  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03460  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0012  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0188639 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Pseudo-1  tRNA-OTHER  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.526537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>