16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_R0048 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_R0048  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0037  tRNA-Ser  95.29 
 
 
85 bp  137  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.517191  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0061  tRNA-Ser  95.29 
 
 
88 bp  137  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.632048 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0043  tRNA-Ser  94.44 
 
 
85 bp  111  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000207344  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0061  tRNA-Ser  90.24 
 
 
84 bp  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.488767  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0009  tRNA-Ser  92.86 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0921241  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0034  tRNA-Ser  92.31 
 
 
85 bp  54  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184009  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0208522  hitchhiker  0.00000010286 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0042  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.309663  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0027  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000116718  hitchhiker  6.42112e-17 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0068  tRNA-Ser  100 
 
 
96 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.569209  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0063  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.6315500000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0064  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.59858e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000625255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>