61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_R0038 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna38  tRNA-Ser  98.63 
 
 		 91 bp  137  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0026  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 91 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0026  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 91 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.199991  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0025  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 91 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0049  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0044  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_003295  RS01162  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0018  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0060  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 91 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0238234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0026  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 91 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0035  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387862 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0057  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 91 bp  67.9  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0008  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 91 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682729 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0037  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.552726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0026  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0049  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.430745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0037  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.244587  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0039  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0837952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0034  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0467968  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0009  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 91 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0314444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0044  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.417846 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0006  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0046  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40906  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0029  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0025  tRNA-Ser  97.5 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000078606  normal  0.16194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0006  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0041  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0730439  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0051  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0009  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0050  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0567726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0023  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000401861 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0061  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0952351  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0034  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184009  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0033  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0034  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.355586  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna37  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0032  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1941  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0029  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.467256 
 
 
-
 
NC_003295  RS03460  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0034  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.597346 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0070  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.399314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer01  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0568907  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0062  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2014  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0295784  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0062  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0024  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2051  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0533  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0631  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985518  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1078  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0381421  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0785  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0036  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688413  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0060  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0088  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0062  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>