22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_R0061 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_R0061  tRNA-Ser  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.488767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0061  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 88 bp  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.632048 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0037  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 85 bp  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.517191  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0048  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 85 bp  91.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0043  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000207344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0009  tRNA-Ser  85.9 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0921241  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0034  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184009  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0020  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.417129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000388656  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0004  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0002  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0003  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0503535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0001  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.365193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0002  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0045  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011189  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0018  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583906 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0045  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00148219  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.223557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0013  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>