17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_R0004 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_R0013  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.223557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00148219  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0020  tRNA-Ser  91.49 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0010  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000388656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0020  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.417129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0018  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.424159  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0002  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0003  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0503535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0001  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.365193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0002  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0045  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011189  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0009  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0004  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0061  tRNA-Ser  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.488767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>