109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_R0054 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_R0055  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.265922  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0054  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.35196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129701  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.124384  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS01162  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  87.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0046  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  79.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40906  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0006  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  79.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0071  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  79.8  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.612949  normal  0.325522 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0037  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  79.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.552726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0039  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  79.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0837952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0013  tRNA-Ser  87.14 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.315866  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0076  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0044  tRNA-Ser  86.11 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0001  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0075  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0026  tRNA-Ser  89.09 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0052  tRNA-Ser  86.11 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.360325 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  84.09 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.86368  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0054  tRNA-Ser  84.09 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0041  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0730439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0040  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0049  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0051  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0044  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0050  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0567726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0023  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000401861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0009  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56396 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0049  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.430745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0037  tRNA-Ser  86.44 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.244587  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0023  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290353  normal  0.259608 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0011  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.785527  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0032  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891342 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0045  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000102929  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0046  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000102929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0051  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0050  tRNA-Ser  83.52 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000005871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0044  tRNA-Ser  88.33 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.417846 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0014  tRNA-Ser  82.95 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0037  tRNA-Ser  82.95 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.489158 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0025  tRNA-Ser  81.82 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000078606  normal  0.16194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0006  tRNA-Ser  88.33 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0061  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.318482  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0018  tRNA-Ser  85 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0035  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0067  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.978703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0039  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0031  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 95 bp  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0583145  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0032  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0576643  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0033  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000268817  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0002  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 93 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0011  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 93 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0002  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 93 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000353165 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57943  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt19  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00413231 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Pseudo-1  tRNA-OTHER  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.526537  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.510614  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.232156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0009  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.39796e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0066  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0053  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0022  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.155688  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0011  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0031  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.110532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0034  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0031  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0145328  normal  0.103161 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0004  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.442962  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0006  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0037  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.12584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0005  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0203622  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0029  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0023  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220081 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0048  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0025  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0042  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.713884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0051  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.250098  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t35  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0008    96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0798492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0058  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0044  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000135641  normal  0.305478 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0022  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0002  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0003  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0003  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0009  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.4364  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0024  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.107228  normal  0.17939 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0046  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.506638  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0053  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0350418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0002  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00130042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0021  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00559548  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0057  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0056  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607701  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA5  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0419374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0671  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0776  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0954361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0026  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23198  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0012  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0188639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0003  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.642958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0006  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>