88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_R0002 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309197  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.159743  normal  0.113678 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1783  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 92 bp  71.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.762858  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t35  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0016  tRNA-Ser  86.84 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.116346  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309262  tRNA-Ser  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309153  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309109  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.701033  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309077  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537864  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0019  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0035  tRNA-Ser  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0013  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0020  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.178349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0023  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0350169 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2818  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000985587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1149  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000101348  hitchhiker  0.0000000000000214207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0969  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000352025  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0004  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0026  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23198  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0059  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0004  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0006  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0906398  normal  0.0288361 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0052  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0042  tRNA-Ser  88 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309348  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366383 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0036  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688413  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0060  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.943942 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0001  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0024  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0029  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.467256 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2051  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0533  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0062  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0062  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0631  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985518  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0001  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0785  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0088  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03460  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0034  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0005  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 95 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1941  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0070  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.399314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0033  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.597346 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2014  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0295784  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0042  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 93 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00852582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1078  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0381421  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0062  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0060  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0308  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna37  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0065  tRNA-Ser  87.23 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0085  tRNA-Ser  87.23 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna38  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0032  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0008  tRNA-Ser  87.23 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0909337  hitchhiker  0.00840657 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0030  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4609  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0062  tRNA-Ser  87.23 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2408  normal  0.378741 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0033  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0014  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0037  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.489158 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0062  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52560  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00373165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309260  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309375  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.748623  hitchhiker  0.000994808 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0034  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.355586  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0060  tRNA-Ser  87.23 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0072  tRNA-Ser  87.23 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.789725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0017  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.54444  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0070  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0030  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.596087  normal  0.116932 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0026  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0043  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710531 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4306  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0052  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.360325 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0051  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0023  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220081 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer01  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0568907  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0007  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0033  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000268817  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0032  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0576643  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0031  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0583145  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0039  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0031  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0145328  normal  0.103161 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0012  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0188639 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Pseudo-1  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.526537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>